24小时热门版块排行榜    

查看: 4704  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

swfctheochem

铜虫 (初入文坛)

[求助] 关于gaussian09中BSSE校正

在论坛上看到以下内容:
要计算A、B两个分子的相互作用能,在Gaussian03中使用counterpoise=2关键字(可简写为counter=2),会计算5个体系,输出的能量按照如下顺序:
E_AB:A、B基组下AB复合物的能量
E_A,bAB:A、B基组下A的能量
E_B,bAB:A、B基组下B的能量
E_A:A基组下A的能量
E_B:B基组下B的能量
最后会输出corrected energy (E_corrected)和BSSE energy (E_BSSE)。E_BSSE是校正能,E_BSSE = (E_A - E_A,bAB) + (E_B - E_B,bAB) ;E_corrected就是消除了因单体基组重叠造成的能量降低后的AB复合物能量,E_corrected = E_AB + E_BSSE。
BSSE校正后的真实的相互作用能可以这样计算:E_interaction = E_corrected - (E_A + E_B)。也可以这样计算,是等价的:E_interaction = E_AB - E_A,bAB - E_B,bAB。
我用gaussian09计算两个分子的相互作用能,输入格式如下
# MP2/6-31+G** Counterpoise=2 Opt
Counterpoise with Cartesian
0,1
分子描述

发现输出结果中只有如下两项:
Counterpoise: corrected energy =    -734.521269484568
Counterpoise: BSSE energy =       0.003653491328
这两项应该就是上面说的corrected energy (E_corrected)和BSSE energy (E_BSSE)。那么前面五项在哪里啊?没有E_A和E_B也算不了最终的相互作用能啊!难道我还要单独计算E_A和E_B吗?按上面的说法应该一次计算就可得到结果啊!哪里出错了?是03和09输出格式的区别吗?另外out文件的最后给出MP2=-385.2025592,这似乎是其中一个分子的总能量,那么另一个分子的能量在哪里?直接用Counterpoise=2 Opt,并没有做频率分析,如果单独算A和B的能量,需要做频率分析考虑零点能吗?第一次计算BSSE,请各位指点!非常感谢!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xjcumt

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
10楼: Originally posted by liyan620 at 2015-04-21 01:16:58
请问楼主我的BSSE.LOG文件中也有好几个SCF done 数值,那么计算相互作用能是该用最后一个吗?

你为什么加优化呢
11楼2015-12-30 10:48:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

xjyuefan

铁杆木虫 (正式写手)

两个体系,那分子坐标是分开写吗?
2楼2013-08-11 11:40:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

swfctheochem

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xjyuefan at 2013-08-11 11:40:21
两个体系,那分子坐标是分开写吗?

不用分开写啊,每个原子后面有数字描述该原子是属于哪个片段的
3楼2013-08-12 13:33:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
swfctheochem: 金币+10, ★★★很有帮助, 很有帮助 2013-08-20 21:20:25
搜索"EUMP2",我不信就给你一个能量。
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭,其实这是修养不足学识浅薄的一种体现,也是可恶的偏执和愚蠢的自以
4楼2013-08-13 00:11:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[职场人生] 40+中年人失业后,还能找到好工作吗? +9 xqy2009 2026-10-13 11/550 2026-10-15 16:37 by beefly
[有机交流] 用NBS溴化时溶剂除了CCl4外还有什么 +3 18834002860 2026-10-12 6/300 2026-10-15 14:30 by 长沙摩尔信息科�
[基金申请] 申请科研项目纯靠实力能成功吗? 200+7 David1982 2026-10-13 11/550 2026-10-15 10:30 by zyqchem
[硕博家园] 极限拉扯,如何抉择 +11 Isak0320 2026-10-12 15/750 2026-10-14 21:55 by 猫鱼不是鱼
[论文投稿] 二审4个多月了还是Awaiting Reviewer Scores 10+3 纳斯达克ML 2026-10-11 4/200 2026-10-14 17:30 by babero
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了,离AI做有机合成还有多远? +8 wangyl_123 2026-10-10 13/650 2026-10-14 15:12 by zuesli
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么? +4 好运来~9527 2026-10-10 7/350 2026-10-13 08:41 by xli1984
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷!
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
信息提示
请填处理意见