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mingmbm

铜虫 (小有名气)


[交流] deposit

各位大神,我最近早做沉积的模拟,用到deposit命令,部分in.文件为
compute         C_temp Film temp
compute_modify  C_temp dynamic yes
fix            1 g_adatom nve
fix             2 g_fix setforce 0.0 0.0 0.0
fix             3 g_heat temp/berendsen 300.0 300.0 100.0
fix             4 all deposit 50 1 5000 430392 region r_adatom vx 0.1 0.1 vy 0.0 0.0 vz -0.2 -0.2 units box
#velocity      g_adatom set -0.1 0.0 -0.1 units box
thermo_modify   temp C_temp lost ignore norm yes
thermo_style custom step temp c_C_temp pe etotal press vol
但在运行后,添加的原子就停在r_adatom,没有初速度,这是什么原因,我赢的边界条件为 p p f,
请各位大神指教,我改怎么改,才能让增加的原子有速度 Sample Text
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天泊乐

金虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你有没有对r_adatom区域的原子进行相应的integration更新位置,速度等信息啊?
2楼2013-08-12 09:11:48
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mingmbm

铜虫 (小有名气)


引用回帖:
2楼: Originally posted by 天泊乐 at 2013-08-12 03:11:48
你有没有对r_adatom区域的原子进行相应的integration更新位置,速度等信息啊?

我在r_adatom区域用了NVE 系综积分,但也没用,你能讲详细些吗,谢谢
3楼2013-08-13 15:49:22
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mingmbm

铜虫 (小有名气)


各位,求助?
在dump文件中可以看到原子上有速度显示,但原子的位置一直不动,像各位大神求解。
4楼2013-08-19 15:28:15
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cuiyufeiv5

铜虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你的units是啥,你这速度给的太小了吧
5楼2016-04-21 09:53:47
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alundilong

木虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主可以把
fix            1 g_adatom nve中的group改成all就可以了。

lammps中默认的group都是静态的,即当有原子增减后,原来定义的group中的原子并不更新。另外,默认的位移动态group只有一个,就是all。楼主也可以自定在定义group的时候,定义为动态group也可以,但是费时。
6楼2016-04-22 00:54:48
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skplin

铜虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个命令可以在几个颗粒上沉积吗?也就是在这几个颗粒上长大
7楼2017-03-12 10:52:33
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你来说说看

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你的速度设置的0.1太小了吧,算一下实际速度比对一下,
8楼2017-03-20 23:01:41
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