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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 氨氧化细菌
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zx1990

金虫 (小有名气)

[求助] 氨氧化细菌

氨氧化细菌的片段长度为491，可是我送出去克隆的样品，测序得到的结果却只有452bp，请问这是什么原因？
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1楼 2013-08-04 21:52:49
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mmz123250

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by zx1990 at 2013-08-06 07:40:39
我送去测序的就是阳性菌液，而且我在ncbi上查到的也是452bp...

菌液检测，可能还存在一个问题，就是污染问题。可以尝试提取质粒，送vector测序。
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4楼2013-08-06 09:28:56
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mmz123250

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
有时候测序，起始段和末尾段测不准。最好是构建载体，送含目的片段的Vector去检测，或阳性菌液。
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2楼2013-08-05 16:47:00
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zx1990

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by mmz123250 at 2013-08-05 16:47:00
有时候测序，起始段和末尾段测不准。最好是构建载体，送含目的片段的Vector去检测，或阳性菌液。

我送去测序的就是阳性菌液，而且我在ncbi上查到的也是452bp
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3楼2013-08-06 07:40:39
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zx1990

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by mmz123250 at 2013-08-06 09:28:56
菌液检测，可能还存在一个问题，就是污染问题。可以尝试提取质粒，送vector测序。...

呃，我送去的是质粒，在华大测序的，人家测序的时候是提取的质粒啊
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5楼2013-08-07 08:46:17
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