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汕头大学海洋科学接受调剂
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stevenabing

至尊木虫 (正式写手)


[资源] Platon在晶体描述时的用法(氢键、pai-pai堆积、构象)

我一般与WINGX连用,在wingx--〉analyse-->Calv(full),计算完后,在你的文件目录生成一个名为platon.1st文件,打开可以找到很多有用的东西,包括环的构象,如椅式、船式、扭船式等,还有绝对构型参数,还有氢键参数,还有堆积参数,还有好多好多的东西。
platon一般不直接用,不好用,也可以通过与PWT联合使用,一般下载platon,人家都会推荐再下载一个PWT的,在pwt中也是有一栏publish--〉calv all,计算的结果保存在以你的文件名为名,后缀为lis的文件中,可以用记事本或写字板打开,晶体相关的文件一般都可以用这两个程序打开的。
其实wingx和pwt都是一个壳,他们把很多软件集合起来,然后给出一个图形界面,这样就好操作了。

此外,关于pai-pai堆积的标准见我的另外一个帖子:
http://www.muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=581690

[ Last edited by stevenabing on 2007-11-6 at 16:18 ]
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douvei

金虫 (正式写手)


希望楼主能够完善一些
我也做了一个,比楼主还简洁
共同努力把
10楼2007-11-14 02:40:27
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djhycu

银虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

好东东啊!
真是感谢!
2楼2007-11-06 13:57:08
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zdc_2006

木虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

请问LZ,用PLATON 计算后,按您说的方法在LIS文件当中是可以找到pai-pai堆积数据,请问哪些数据是需要的呢?有什么标准吗?
因为计算出好多pai-pai堆积数据,所以不知道要把哪些写在CIF文件上。
先谢谢啦!
3楼2007-11-06 15:54:03
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zhangyongfeng

木虫 (著名写手)


★ 一星级,一般

下载以后,没法解压!
5楼2007-11-07 12:37:05
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