24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1458  |  回复: 8
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

尼尔墨客

铜虫 (小有名气)


[交流] 基因序列

如果一种植物没有研究过,任何没有任何序列报道,是不是只能依靠模式植物同源测序?

cexu

[ Last edited by 尼尔墨客 on 2013-8-31 at 03:35 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

蛋白质生物学实验经验 核酸生物学实验经验 细胞生物学实验经验

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
建立信号传导途径时参考已有的信号传导途径。
9楼2013-08-06 00:35:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

bullfrog325

木虫 (正式写手)


★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
尼尔墨客: 金币+1 2013-08-04 20:50:58
楼主你确认要这样做这个项目?
楼主的思路是对的, 但是在没有任何前期研究i和序列信息的情况下做分子机制很难很难
3楼2013-08-04 17:59:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

尼尔墨客

铜虫 (小有名气)


引用回帖:
3楼: Originally posted by bullfrog325 at 2013-08-04 17:59:51
楼主你确认要这样做这个项目?
楼主的思路是对的, 但是在没有任何前期研究i和序列信息的情况下做分子机制很难很难

没确定,就是在想计划,因为这方面很不懂,方向是研究植物发育方面信号转导,又不知道该怎么深入做下去
4楼2013-08-04 20:54:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
尼尔墨客: 金币+9, 哇你好厉害 金币全给你了 但是我太菜了看不太懂 2013-08-05 22:24:18
研究方法很多了,你可以从信号途径中的蛋白质入手,其中末端蛋白质可以指向是不是该信号途径是通过基因表达调控发挥作用的,实际研究时可以末端蛋白质出发往前找。基本研究方法是DNAProtein interaction,Protein-Protein
interaction,基因或者蛋白质的功能四个方面的研究方法。

一、确定一个未知基因的功能的实验方法有很多,比如:基因敲除,酵母双杂交,定点突变,基因过表达,噬菌体展示等。
另外如果已知该GENE(如果它编码蛋白质的话)的表达出的蛋白质的一级结构和三维结构已经获得,比如用X-RAY衍射或NMR等测定,再利用TOP3D查询本地PDB库,以及查询DALI数据库,去找出较为相似的结构或同源蛋白质可推测未知蛋白质的功能。如果找不到相似的结构或同源蛋白质,而且所研究的GENE编码的蛋白质的一级结构和三维结构,那么你就应从其局部结构入手,看其有关的domain,motif有哪些?然后去查阅有关的domain,motif的可能功能,再去比较一下有这些domain,motif的蛋白质的功能有哪些?还可比较与你的新蛋白质的空间结构相似的以知蛋白质(两者一级结构可有较大不同)的功能有哪些?可用免疫检测。完全避开从GENE EXPRESSION角度去确定一个未知PROTEIN的功能,这在目前不大可能,别的不说,即使从蛋白质的一级序列用生物信息学和理论生物物理学方法推出二级结构都不是很准(无论具体用何种算法),从蛋白质的三维结构预测其功能,即使有同源蛋白质也很不容易,而且只不过是猜测,没有实验证据证明都不可信!完全从生物信息学的手段获得功能信息,可能根本无实际价值。当然做些猜测,可用上面的思路。最终要考第一段的实研方法。
基因的异位表达或者过表达也是有效的研究基因的功能的试验方法,比如2006年iPS cell的长生就是使用了基因的异位表达或者过表达方法。

二、信号转导末端靶蛋白的主要类型及其发挥作用的方式包括:
1.代谢酶,影响细胞代谢;2.基因表达调控蛋白:激活或抑制基因表达:3.细胞骨架蛋白:改变细胞形状和运动。
    ------参见:翟中和、王喜忠、丁明孝 主编,细胞生物学,高教出版社,2011年,第四版,第162页,图9-7.原图是说明细胞表面受体介导的细胞信号传导系统的组成。
       实际上还有如NO,CO气体信号分子直接透过细胞膜与胞内受体相互作用的信号传导途径和甾族分子、维生素D、维甲酸等亲脂分子,透过细胞质膜与核膜与细胞核内受体结合而调控基因表达。
      但是NO,CO气体信号分子直接透过细胞膜与胞内受体相互作用的信号传导途径的信号转导末端靶蛋白也是代谢酶,甾族分子、维生素D、维甲酸等亲脂分子,透过细胞质膜与核膜与细胞核内受体结合而调控基因表达的信号转导末端靶蛋白也是基因表达调控蛋白,所以“信号转导末端靶蛋白的主要类型及其发挥作用的方式包括:1.代谢酶,影响细胞代谢;2.基因表达调控蛋白:激活或抑制基因表达:3.细胞骨架蛋白:改变细胞形状和运动”,仍然成立!
信号通路远不止三种,细胞信号传导系统的细胞表面的介导受体的就包括:离子通道偶联受体、G蛋白偶联受体和酶联受体三种,至于转录因子属于细胞信号通路的末端蛋白质之一的基因表达调控蛋白,但是.基因表达调控蛋白不只限于转录因子。
5楼2013-08-05 00:32:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 329求调剂 +6 星野? 2026-03-26 6/300 2026-03-28 14:14 by 唐沐儿
[考研] 277跪求调剂 +5 1915668 2026-03-27 9/450 2026-03-28 09:58 by zhshch
[考研] 086502化学工程342求调剂 +6 阿姨复古不过 2026-03-27 6/300 2026-03-28 07:06 by wangy0907
[考研] 085701环境工程求调剂 +9 多久上课 2026-03-27 9/450 2026-03-28 03:58 by fmesaito
[考研] 352分 化工与材料 +5 海纳百川Ly 2026-03-27 5/250 2026-03-28 03:39 by fmesaito
[考研] 一志愿上海理工能源动力(085800)310分求调剂 +3 zhangmingc 2026-03-27 4/200 2026-03-27 19:01 by 给你你注意休息
[考研] 考研调剂 +4 Sanmu-124 2026-03-26 4/200 2026-03-27 17:49 by kiokin
[考研] 一志愿南师大0703化学 275求调剂 +4 Ripcord上岸 2026-03-27 4/200 2026-03-27 17:00 by zhyzzh
[考研] 08开头275求调剂 +4 拉谁不重要 2026-03-26 4/200 2026-03-27 14:12 by Delta2012
[考研] 调剂推荐 +5 清酒714 2026-03-26 6/300 2026-03-27 11:12 by 不吃魚的貓
[论文投稿] Journal of Mechanical Science and Technology +3 Russ_ss 2026-03-25 5/250 2026-03-27 10:49 by 陆小果画大饼
[考研] 材料学硕,求调剂 6+5 糖葫芦888ll 2026-03-22 10/500 2026-03-27 08:18 by hypershenger
[考研] 材料调剂 +8 匹克i 2026-03-23 8/400 2026-03-27 08:11 by hypershenger
[考研] 调剂求收留 +7 果然有我 2026-03-26 7/350 2026-03-27 00:26 by wxiongid
[考研] 中国科学院深圳先进技术研究院-光纤传感课题组招生-中国科学院大学、深圳理工大学联培 +5 YangTyu1 2026-03-26 5/250 2026-03-26 18:27 by 猫咪猫咪呀
[考研] 085602化学工程求调剂。 +4 平乐乐乐 2026-03-26 4/200 2026-03-26 17:57 by fmesaito
[考研] 318求调剂 +5 plum李子 2026-03-21 8/400 2026-03-25 09:26 by aa331100
[考研] 环境学硕288求调剂 +8 皮皮皮123456 2026-03-22 8/400 2026-03-23 23:47 by 热情沙漠
[考研] 一志愿东华大学化学070300,求调剂 +7 2117205181 2026-03-21 8/400 2026-03-22 22:55 by chixmc
[考研] 306求调剂 +5 来好运来来来 2026-03-22 5/250 2026-03-22 16:17 by BruceLiu320
信息提示
请填处理意见