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分子动力学的 ADMP 该如何设定温度
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我目前尝试用Gaussian 中 ADMP进行 分子动力学的模拟 输入档如下 #b3lyp/6-31++g(d,p) admp=maxpoints=10 IOP(1/80=1000000,1/81=1,1/82=500,1/89=1) title 1,1 C 0.53346723 0.05849264 0.31010108 C -1.60293444 0.38889993 0.55333428 C -1.34189470 -0.54936854 -0.60971732 O -0.45541151 0.17114853 1.36443082 O -0.03254012 -0.16169929 -1.00646069 O 1.77146835 0.14411290 0.51889036 H -1.63352428 1.40194629 0.21025800 H -2.51862395 0.17843365 1.06530760 H -2.05973139 -0.45187708 -1.39718535 H -1.34689706 -1.56487646 -0.27264368 Li 2.98584505 -0.01568228 -0.92050351 因为我再ADMP的关键词中找不到关于温度的关键词 所以我参考了 ( http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=5431433 ) 这篇帖子中提供的设定 我有回去官网找IOP各项设定代表的意思 ( http://www.gaussian.com/g_tech/g_iops/ov1.htm#1-80 ) 例如 IOp(1/81) Nuclear KE thermostat in ADMP -- temperature is checked and scaled every IOp(81) steps. IOp(1/82) L121: Temperature for nuclear KE thermostat. 其中IOP(1/82)=350的这个部分 按照我的逻辑应该是指350kelvin 但跑完之后 我从输出档内看到 Thermostat chosen for nuclear motion. Option = 1 Thermostat temperature = 0.016626 hartrees Thermostat range = 0.016578 to 0.016673 hartrees 在里面写的温度 不是用kelvin标示 但是我把hartree经过换算成kelvin后 仍然不是350kelvin 想请问这究竟是怎么回事 ? 我已经尽量把所有信息都提供上来，还希望有人能替我解答解答 或者有人能告诉我ADMP该如何设定他的温度 ? [ Last edited by x39988 on 2013-7-25 at 19:29 ] |
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