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xiaoxue_qiqi

新虫 (初入文坛)

应助: 2 (幼儿园)
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[交流] 有关于KEGG通路注释已有1人参与

KEGG通路注释的时候，分很多层次
如图片就有如下这些
举例对于人类来说，hsa的图片和ko的图片是什么具体区别呢？
我的感觉是hsa的图片是确定是人类通路图了
ko的是直系同源，不分具体物种
像用David注释出来的，就是hsa的图片，但是在某些公司做的结果，却又是ko的图，感觉用hsa的更准
大家讨论一下！

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1楼 2013-07-25 16:03:36

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

hugh_hang

至尊木虫 (正式写手)

BioEPI: 1
应助: 6 (幼儿园)
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红花: 8
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在线: 137.5小时
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注册: 2012-01-20
性别: GG
专业: 植物学研究的新技术、新方

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
wizardfan: 金币+2, 谢谢分享经验 2013-07-27 17:45:20

有物种针对性的情况下，肯定是“(物种名)00xxx”更准确，其中的绿框的反应是该物种里有活性的，点开链接可以查看具体信息，白框的反应没有链接，说明该反应在该物种里活性很低或不在此通路中表达，不过并不能说明该物种中没有这步反应的基因或酶。

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miracles happen everyday, some people don't think so but they do!

2楼2013-07-27 10:10:23