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xiaoxue_qiqi

新虫 (初入文坛)

[交流] 有关于KEGG通路注释 已有1人参与

KEGG通路注释的时候,分很多层次
如图片就有如下这些
举例对于人类来说,hsa的图片和ko的图片是什么具体区别呢?
我的感觉是hsa的图片是确定是人类通路图了
ko的是直系同源,不分具体物种
像用David注释出来的,就是hsa的图片,但是在某些公司做的结果,却又是ko的图,感觉用hsa的更准
大家讨论一下!
有关于KEGG通路注释
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hugh_hang

至尊木虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
wizardfan: 金币+2, 谢谢分享经验 2013-07-27 17:45:20
有物种针对性的情况下,肯定是“(物种名)00xxx”更准确,其中的绿框的反应是该物种里有活性的,点开链接可以查看具体信息,白框的反应没有链接,说明该反应在该物种里活性很低或不在此通路中表达,不过并不能说明该物种中没有这步反应的基因或酶。
miracles happen everyday, some people don't think so but they do!
2楼2013-07-27 10:10:23
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