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njut007银虫 (小有名气)
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[交流]
求助:MOPAC优化阳离子程序问题
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用MOPAC优化一个阳离子,自己编了输入的程序,但是运行老是出错 错误情况如下: 原部分编程如下(其中第二个N为+1价): C 0.000000 0 0.000000 0 0.000000 0 0 0 0 N 1.319960 0 0.000000 0 0.000000 0 1 0 0 C 1.319053 1 110.870396 1 0.000000 0 2 1 0 C 1.405313 0 105.679277 0 -0.017126 0 3 2 1 N 1.319383 0 105.774905 0 -0.006257 0 1 2 3 C 1.441586 0 124.512243 0 -179.994714 0 2 1 5 C 1.442559 1 124.638443 1 179.988212 1 5 1 2 H 1.070000 1 126.558156 1 179.961790 1 1 2 3 H 1.070000 0 127.160361 0 179.982874 0 3 2 1 H 1.070000 0 127.112547 0 179.993743 0 4 3 2 H 1.070000 0 109.471221 0 0.000000 0 6 2 1 H 1.070000 1 109.471221 1 -120.000000 1 6 2 1 H 1.070000 1 109.471221 1 120.000000 1 6 2 1 但是运行结果提示读入出错: The fault detected is in the last line printed GEOMETRY IS FAULTY. GEOMETRY READ IN IS: C 1.405313 0 105.679277 0 -0.017126 0 3 2 1 N 1.319383 0 105.774905 0 -0.006257 0 1 C 1.441586 0 124.512243 0 -179.9947 1 4 0 2 N 1.442559 1 1.000000 1 1.000000 1 1 5 0 O 1.070000 1 1.000000 1 1.000000 1 1 1 0 The fault detected is in the last line printed GEOMETRY IS FAULTY. GEOMETRY READ IN IS: H 1.070000 0 127.160361 0 179.982874 0 3 2 1 H 1.070000 0 127.112547 0 179.993743 0 4 H 1.070000 0 109.471221 0 0.000000 0 6 Mg 1.070000 1 1.000000 1 1.000000 -1 1 6 0 Al 1.070000 1 1.000000 1 1.000000 1 1 6 0 不知道是什么原因,会不会是跟我优化的是阳离子有关,系统默认 N 价键不符合??望指点修改 |
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snoopyzhao
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AM1 POLAR DIPOLE ENPART PRECISE SYMMETRY BONDS CHARGE=1 [No Title] C 0.000000 0 0.000000 0 0.000000 0 0 0 0 N 1.319960 0 0.000000 0 0.000000 0 1 0 0 C 1.319053 1 110.870396 1 0.000000 0 2 1 0 C 1.405313 0 105.679277 0 -0.017126 0 3 2 1 N 1.319383 0 105.774905 0 -0.006257 0 1 2 3 C 1.441586 0 124.512243 0 -179.994714 0 2 1 5 C 1.442559 1 124.638443 1 179.988212 1 5 1 2 H 1.070000 1 126.558156 1 179.961790 1 1 2 3 H 1.070000 0 127.160361 0 179.982874 0 3 2 1 H 1.070000 0 127.112547 0 179.993743 0 4 3 2 H 1.070000 0 109.471221 0 0.000000 0 6 2 1 H 1.070000 1 109.471221 1 -120.000000 1 6 2 1 H 1.070000 1 109.471221 1 120.000000 1 6 2 1 ------ 这是你的输入文件,注意最后面的那个空行,严格意义上来说是必须的。但似乎也不绝对。 只是关键词部分似乎有一些问题。比如 chemoffice 2004 中的 mopac 2000 提示,POLAR 不能用在开壳的RHF 计算中。但 MOPAC 2007 便无此提示。 不过在 2007 中, DIPOLE 成了不可识别的关键词,呵呵 |
8楼2007-11-03 17:41:04
alwens
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