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liweiyi123456铁杆木虫 (职业作家)
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[求助]
请问谁用DFT-D3算过dispersion effect的?
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DFTD3 的程序安装非常简单 1. 在linux下面 解压程序包 tar zxvf dftd3.tgz 2. 将Makefile里面的fortran编译器改成你机器上安装的,如果你的机器恰好装的是ifort,此过程忽略 3. make 出现dftd3 装好了。 gaussian默认的坐标我不知道dftd3是不是支持,如果不支持,改成.xyz格式,比如你用 B3LYP优化, 然后 dftd3 ***.xyz -func b3-lyp -zero 就可以了。 这些程序附件的说明书里都写的很清楚,说明书非常短,正文只有4页半,为什么不看一下呢? |
6楼2013-07-26 09:01:30
【答案】应助回帖
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liweiyi123456: 金币+10, ★★★很有帮助 2013-07-24 11:20:24
gmy1990: 金币+2 2013-07-24 16:49:23
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gmy1990: 金币+2 2013-07-24 16:49:23
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两种方法: 1. Gaussian 09 D.01已经可以方便计算 Several new DFT functionals and two new empirical dispersion models have been added。 2. Grimme主页上有单独的D3计算程序。 看你哪一个方便了。 |
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2楼2013-07-24 11:18:05
liweiyi123456
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3楼2013-07-24 11:20:57
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gmy1990: 金币+2 2013-07-24 16:49:41
gmy1990: 金币+2 2013-07-24 16:49:41
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程序包里面自带说明书的,看一下就明白了。 给你举个例子,我用的是vasp,PBE,DFT-D3修正, 先用vasp把结构优化好,得到CONTCAR文件, 然后吧dftd3这个软件包安装好, 运行 dftd3 CONTCAR -pbc -func pbe -zero 其中 -pbc是说周期场(VASP计算的结果) -func是说你用的泛函,不同的泛函修正参数不同,要指定的,我用的是PBE所以是 -func pbe -zero 是一种DFT-D3的修正方法, -old 是DFT-D2修正,-zero是 damping 为零的DFT-D3修正, -bj是用 BJ 的方法做damping 的DFT-D3修正。 作者推荐-bj,不过我喜欢-zero |
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4楼2013-07-24 12:13:59














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liweiyi123456