| 查看: 2380 | 回复: 11 | |||
liweiyi123456铁杆木虫 (职业作家)
|
[求助]
请问谁用DFT-D3算过dispersion effect的？
|
||
| 帮帮我吧，从安装，到计算 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 vasp 学习贴 |
» 猜你喜欢
一志愿厦门大学化学学硕307求调剂
已经有19人回复
-
一志愿南师大0703化学 275求调剂
已经有6人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有246人回复
-
理论与计算化学方向调剂——初试388分（数学144）
已经有2人回复
-
A 区过线就可申！重庆双非公办高校 0856调剂，接受跨专业！纳米材料 / 润滑热门方向
已经有0人回复
-
欢迎调剂长江师范学院汤老师课题组的硕士研究生
已经有0人回复
-
硕士研究生调剂
已经有0人回复
-
中国电机工程学报的投稿系统
已经有0人回复
-
投稿期刊求助
已经有1人回复
-
江西师大化学工程学院调剂今晚0点开放！ 缺额100个，速冲！
已经有0人回复
-
图书求助：Fluorescent Probes for Bioactive Species: Design
已经有0人回复
liweiyi123456
铁杆木虫 (职业作家)
- 应助: 18 (小学生)
- 金币: 26432.2
- 散金: 4080
- 红花: 7
- 帖子: 4286
- 在线: 469.3小时
- 虫号: 467835
- 注册: 2007-11-27
- 专业: 理论和计算化学
送红花一朵 
3楼2013-07-24 11:20:57
kjsun
木虫 (正式写手)
- 应助: 34 (小学生)
- 金币: 5557.5
- 散金: 100
- 红花: 5
- 帖子: 434
- 在线: 469.8小时
- 虫号: 285070
- 注册: 2006-10-14
- 性别: GG
- 专业: 催化化学
★ ★
gmy1990: 金币+2 2013-07-24 16:49:41
gmy1990: 金币+2 2013-07-24 16:49:41
|
程序包里面自带说明书的，看一下就明白了。 给你举个例子，我用的是vasp，PBE，DFT-D3修正， 先用vasp把结构优化好，得到CONTCAR文件， 然后吧dftd3这个软件包安装好， 运行 dftd3 CONTCAR -pbc -func pbe -zero 其中 -pbc是说周期场（VASP计算的结果） -func是说你用的泛函，不同的泛函修正参数不同，要指定的，我用的是PBE所以是 -func pbe -zero 是一种DFT-D3的修正方法， -old 是DFT-D2修正，-zero是 damping 为零的DFT-D3修正， -bj是用 BJ 的方法做damping 的DFT-D3修正。 作者推荐-bj，不过我喜欢-zero |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
4楼2013-07-24 12:13:59
liweiyi123456
铁杆木虫 (职业作家)
- 应助: 18 (小学生)
- 金币: 26432.2
- 散金: 4080
- 红花: 7
- 帖子: 4286
- 在线: 469.3小时
- 虫号: 467835
- 注册: 2007-11-27
- 专业: 理论和计算化学
5楼2013-07-25 22:42:22
liweiyi123456
铁杆木虫 (职业作家)
- 应助: 18 (小学生)
- 金币: 26432.2
- 散金: 4080
- 红花: 7
- 帖子: 4286
- 在线: 469.3小时
- 虫号: 467835
- 注册: 2007-11-27
- 专业: 理论和计算化学
7楼2013-07-26 15:49:34
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
liweiyi123456: 金币+10, ★★★很有帮助 2013-07-24 11:20:24
gmy1990: 金币+2 2013-07-24 16:49:23
感谢参与，应助指数 +1
liweiyi123456: 金币+10, ★★★很有帮助 2013-07-24 11:20:24
gmy1990: 金币+2 2013-07-24 16:49:23
|
两种方法： 1. Gaussian 09 D.01已经可以方便计算 Several new DFT functionals and two new empirical dispersion models have been added。 2. Grimme主页上有单独的D3计算程序。 看你哪一个方便了。 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
2楼2013-07-24 11:18:05
kjsun
木虫 (正式写手)
- 应助: 34 (小学生)
- 金币: 5557.5
- 散金: 100
- 红花: 5
- 帖子: 434
- 在线: 469.8小时
- 虫号: 285070
- 注册: 2006-10-14
- 性别: GG
- 专业: 催化化学
|
DFTD3 的程序安装非常简单 1. 在linux下面 解压程序包 tar zxvf dftd3.tgz 2. 将Makefile里面的fortran编译器改成你机器上安装的，如果你的机器恰好装的是ifort，此过程忽略 3. make 出现dftd3 装好了。 gaussian默认的坐标我不知道dftd3是不是支持，如果不支持，改成.xyz格式,比如你用 B3LYP优化， 然后 dftd3 ***.xyz -func b3-lyp -zero 就可以了。 这些程序附件的说明书里都写的很清楚，说明书非常短，正文只有4页半，为什么不看一下呢？ |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
6楼2013-07-26 09:01:30
千字文
木虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 2280.5
- 散金: 1
- 红花: 2
- 帖子: 293
- 在线: 122.5小时
- 虫号: 1689397
- 注册: 2012-03-14
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
8楼2014-06-21 14:40:49
|
本帖内容被屏蔽 |
9楼2014-06-28 15:29:29
10楼2014-06-29 08:28:30
