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关于GatewayBP反应的很多问题——劳烦各位牛人
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zhenglingyu
铜虫
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帖子: 20
在线: 30.4小时
虫号: 2391402
[交流]
关于GatewayBP反应的很多问题——劳烦各位牛人
最近我一直在做Gateway入门载体BP反应。发现一些问题。
1.BP反应前需要设计一段加接头的基因特异性引物做全长基因pcr扩增,接头序列让我很捉摸不透。师兄告诉我
上游引物前附加:5'-3': GGGGACAACTTTGTACAAAAAAGTTGGA
下游引物前附加:5'-3': GGCGGCCGCACAACTTTGTACAAGAAAGTTGGGTA
可是我发现这跟官方说明书Gatewayman上面的attB PCR Primers序列不一样,我是菜鸟,真的不明白怎么回事,这对后面的BP反应有影响吗。
2.这两天做了BP反应连接转化,挑斑(过夜连接,每个平板大约10几20个斑,很少),然后菌落PCR(M13引物)发现5个基因的电泳条带基本上完全一致,700-800bp左右,而我的5个基因应该是1500bp左右,我捉摸着是不是都是空载体。会不会是都没连接上,也不知道是哪出了问题,用高保真酶扩基因全长条带都很单一也是目的片段,就是不知道为什么会这样,各位大侠牛人教教小女子吧!!
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1楼
2013-07-21 16:49:02
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benita1995
新虫
(初入文坛)
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帖子: 3
在线: 2.9小时
虫号: 4396426
★
zhenglingyu(金币+1): 谢谢参与
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引用回帖:
19楼
:
Originally posted by
zhenglingyu
at 2013-07-25 10:22:58
我的BP反应用的是PDONR221,浓度200ng左右,抗性应该没错都是抗卡那的。昨天测序结果出来了,虽然斑长得很少,但确实有目的片段已经连上载体了,还算庆幸。还有就是刚才大侠说的BP作用位点是什么呢,我看gateway的 ...
你好,我做gateway连接遇到问题了,看到您帖子上说,BP反应后用得抗性是kana,不是zeo吗?
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22楼
2016-03-15 15:34:00
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Sthunder
木虫
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(高中生)
金币: 2337.8
帖子: 308
在线: 176.6小时
虫号: 2551016
★
zhenglingyu(金币+1): 谢谢参与
首先,你所用的引物与我所用的有所出入,我用的是:
F 5’ GGGG ACAAGTTTGTACAAAAAAGCAGGCT TCACC
R 5’ GGGG ACCACTTTGTACAAGAAAGCTGGGT C
其次,BP不是连接哈,他是转换,无论BP OR LR对其浓度要求比较高,请严格按照其说明书要求进行,尤其是BP中的PCR产物浓度,LR中的pZeo浓度。
针对你的情况,建议做个酶切验证,挑取BP产物单克隆,提个质粒,然后用Mlu I 做个酶切看看。
Good luck!
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13楼
2013-07-22 08:34:45
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