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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 刺激后，RNA水平8h持续3天下调，蛋白在5天之前高表达，而后下调，bug？
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butterflyff

新虫 (小有名气)

[求助] 刺激后，RNA水平8h持续3天下调，蛋白在5天之前高表达，而后下调，bug？

细胞刺激后RNA水平8h后持续下调，蛋白在5天之前高表达，7天后开始下调，不知道是否还有意义，如何验证，求各路同门帮忙解答
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1楼 2013-07-20 13:24:52
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

oylb

禁言 (正式写手)
★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助！ 2013-07-20 21:44:32
本帖内容被屏蔽
2楼2013-07-20 15:47:37
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普通回帖

butterflyff

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by oylb at 2013-07-20 15:47:37
楼主表述得不清楚，让人难以准确理解。是说RNA水平很高，维持8h；到第三天之后开始下降？蛋白质前5天高水平，之后开始下降？如果是这样的话，很简单的解释就是RNA与蛋白质的稳定性差异、蛋白质翻译的时间顺序。

...

非常感谢您的帮助。RNA水平：从八小时开始检测一直到72h都是持续下调，没有上调的情况。而蛋白水平从第一天基本没有差异，到3、5天后显著性上调，再后来7、9天下调；很同意您的解释，我也是遮阳想的，但是想找些文章支持却找不到，不知道您是否有这方面的经验，给出实验方案证明或者类似报道的文献，感激不尽
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3楼2013-07-20 16:49:23
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-07-21 07:50:21
检测RNA的表达量可以用Northern Blotting ;检测RNA的表达量可以用Western Blotting.楼主可以突破的点很多，可以从Protein-DNA interaction入手,也可以从RNA-Protein interaction入手，还可以从蛋白质的翻译后加工，不限于一级结构的加工。

楼主愿意，我们可以继续讨论。
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4楼2013-07-20 17:41:08
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-07-21 07:50:32
我给出楼主具体的实验方案，不相信的话可以看我的论坛个人网页，搜一下我给出别人的具体的实验方案，但是你的题目太大了，你要告诉我你的课题的具体要求，我们可以讨论具体的实验方案。
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5楼2013-07-20 17:43:01
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)
★
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-07-21 07:50:40
我可以给出楼主具体的实验方案，不相信的话楼主可以看我的论坛个人网页，搜一下我给出别人的具体的实验方案。

但是楼主的题目太大了，楼主要告诉我：你的课题的具体要求（需要保密的细节内容不必提供，这不影响讨论），然后我们可以讨论具体的实验方案。
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butterflyff
6楼2013-07-20 17:44:31
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oylb

禁言 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
gyesang: 金币+3, 有道理！ 2013-07-20 21:45:24
butterflyff: 金币+50, ★有帮助 2013-10-16 19:41:33
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butterflyff
7楼2013-07-20 19:05:08
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butterflyff

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by oylb at 2013-07-20 19:05:08
首先，根据你的描述，我感觉实验设计的细节不够精确。RNA水平是从8小时到72小时，中间每隔8小时取样？蛋白水平是1、3、5、7、9天检测，每隔两天取样？这个设计就存在问题。RNA在3天（72小时）时下调，那么在5、7、 ...

再次感谢您的帮助。您分析的问题确实存在，应该明确一下后几天RNA水平的变化及8h时的蛋白水平变化。
另外，若精确重复之后，结果可靠，不知道这样的调控结果是否还有意义，因为在体内的话究竟是变化高时起作用，还是变化低时起作用很复杂。根据您的专业，不知道是否遇到过此类表达变化的文章推荐一二，不胜感激
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8楼2013-07-20 20:54:05
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butterflyff

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by 凌波丽 at 2013-07-20 17:44:31
我可以给出楼主具体的实验方案，不相信的话楼主可以看我的论坛个人网页，搜一下我给出别人的具体的实验方案。

但是楼主的题目太大了，楼主要告诉我：你的课题的具体要求（需要保密的细节内容不必提供，这不影响讨 ...

谢谢您，您有这方面的经验吗，遇到过这类问题的文献吗？
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9楼2013-07-20 20:56:07
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starseacow

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-07-21 07:50:51
butterflyff: 金币+10, ★有帮助 2013-10-16 19:41:54
引用回帖:
9楼: Originally posted by butterflyff at 2013-07-20 20:56:07
谢谢您，您有这方面的经验吗，遇到过这类问题的文献吗？...

可以看看这篇文献，其中有结果显示ABA处理后RNA水平与蛋白水平变化不一致
Changhyun Yi, Sohyeon Park, Hye Sup Yun, Chian Kwon
Vesicle-associated membrane proteins 721 and 722 are required for unimpeded growth of Arabidopsis under ABA application
Journal of Plant Physiology
Volume 170, Issue 5, 15 March 2013, Pages 529–533
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butterflyff
植物生理群69993869，为避免广告，申请加入请提供木虫昵称，院校及专业信息
10楼2013-07-20 23:54:23
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