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fengqi3000

铁虫 (小有名气)

[求助] 关于计算void space volume

我的一个非溶剂合物的晶体,在写文章描述的时候提了一句关于该晶体的结构紧密,没有空间容纳溶剂小分子,随即编辑提出所谓的空间有多大,谁知道怎么计算这个void space volume?用什么软件?
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fengqi3000

铁虫 (小有名气)

:: Total Potential Solvent Area Vol     38.3 Ang^3
                  per Unit Cell Vol   2025.2 Ang^3 [ 1.9%]

Note: Expected volumes for solvent molecules are:
      A hydrogen bonded H2O-molecule      40 Ang^3
      Small molecules (e.g. Toluene) 100-300 Ang^3

      Values below for gridpoints and volumes in []
      refer to areas where atom centers may reside.
我用platon的calc all计算,那个38 Ang^3是否就是void space volume?
2楼2013-07-11 20:54:43
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ww6174

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我刚刚算了一个,应该是这个
3楼2013-07-11 22:44:12
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fengqi3000

铁虫 (小有名气)

请问楼上用什么软件算的?
4楼2013-07-11 22:47:56
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fengqi3000

铁虫 (小有名气)

我觉得我之前算的还不是我要的结果,后来用calc void 算,出了个结果packing index, 但找不到volume of void,有没有高手再指点下啊
5楼2013-07-12 00:19:48
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xiaochong98

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
可以从两个方面计算,
1是用platon计算,
2是用mercury计算。
从楼上的数据来看,应该是用wingx中的platon计算的结果。
北京人
6楼2013-07-12 07:37:57
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fengqi3000

铁虫 (小有名气)

能不能讲下具体怎么算?
7楼2013-07-14 21:33:58
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008724

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by fengqi3000 at 2013-07-12 00:19:48
我觉得我之前算的还不是我要的结果,后来用calc void 算,出了个结果packing index, 但找不到volume of void,有没有高手再指点下啊

请问你的问题解决了吗?我也遇到这样的问题。
8楼2018-05-25 10:18:52
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