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wsoso

木虫 (正式写手)

[交流] 有那位知道如何把XRD粉末衍射的原始数据转化成CIF格式

有那位知道如何把XRD粉末衍射的原始数据转化成CIF格式的,麻烦告诉一下,谢谢了!原始数据是raw.text或dat格式,如何转啊?
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velapandou

铁虫 (小有名气)

一般情况下,xrd 粉末衍射数据包含的信息只有衍射角度和对应的衍射强度。以衍射角度为横坐标,衍射强度为纵坐标,就得到一个正常的粉末衍射图。而CIF文件是crystal information file. 有了晶体结构才有CIF文件。搂主说的应该是这个CIF格式吧。所以, 这两种文件无法转化。不过转化XRD粉末衍射数据我很熟。告诉我你想要什么样的格式,我看看能不能转化。
2楼2007-11-03 04:39:36
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wsoso

木虫 (正式写手)

谢谢你!我是投稿,结构数据已经有了,现在它要原始数据,给它原始数据后,它可以检查你解的结果是否正确.而它要的格式是cif格式.我现在就卡在这里了.不知道如何把原始的XRD粉末衍射数据转成cif格式.你能告诉我怎么操作吗?用什么程序转?谢谢
3楼2007-11-06 17:46:22
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wsoso

木虫 (正式写手)

是否我把原始数据发给你,你给我转一下?
4楼2007-11-06 17:51:00
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velapandou

铁虫 (小有名气)

wsoso 给你发短消息了。
5楼2007-11-07 01:02:50
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wsoso

木虫 (正式写手)

velapandou,谢谢你,但我还没解决问题,是这样的
就是投稿到acta E,让上传文件,其他的都传了,就最后一个文件老上不去.需要上传powder diffraction data.我上传了原始数据的dat,text格式都不行.你知道该如何上它需要的格式吗?第一次往那投,不是很清楚.你投过吗?能不能告诉我一下,谢谢了!我是粉末衍射图解的结构.到底它要的是什么啊?你知道吗?
6楼2007-11-08 18:54:44
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velapandou

铁虫 (小有名气)

我没投过acta E。我刚才到那个期刊主页上看了,知道你需要什么了。你把下面的复制并且按照提示继续下去。就应该可以的。

##############################################################################
###    CIF submission form for powder diffraction data (IUCr journals)     ###
###                                              Version 11 February 2005  ###
##############################################################################

# This is an electronic "form" for submitting powder diffraction data in CIF
# format to an IUCr journal.  The data for each powder profile should be sent
# as a separate file consisting of one data block.  The value of _pd_block_id
# is used to associate each powder profile with a Rietveld refinement, since
# it must match the value of _pd_block_diffractogram_id in the CIF used to
# report the results of the refinement. The current version of the powder
# CIF dictionary, which contains definitions of the terms starting _pd_,  
# may be obtained from http://www.iucr.org/iucr-top/cif/pd/index.html.  
# Note that the query marks '?' are significant as placeholders, and should
# not be deleted where a data item is not given, UNLESS the accompanying data
# name is also deleted. Lines should not exceed 80 characters in length.  The
# comments following a hash symbol '#' may be deleted if wished.


data_profile1

_pd_block_id      ?


loop_
      _pd_proc_point_id                    
      _pd_proc_2theta_corrected            
      _pd_proc_intensity_net               
      _pd_calc_intensity_net               
      _pd_proc_ls_weight                  
     1      5        525      524      0.001907   
     2      5.02     524      523      0.001910
     3      5.04     530      529      0.001888
     4      5.06     533      532      0.001878
     5      5.08     526      526      0.001900
     6      5.1      530      529      0.001889
     7      5.12     520      520      0.001923
     8      5.14     526      526      0.001900
     9      5.16     527      526      0.001898
     ....
     继续吧
注: 第一列是1, 2, 3, 4, 。。。
     第二列是衍射角度 (in 2theta)
     第三列是试验数据衍射强度
     第四列是做完计算衍射强度
     第五列是权重, 就是试验数据强度的倒数。
另外注意上面_pd_block_id      ? 的问号要改成与你送的晶体结构cif文件的一致。

如果还有问题的话, 你就得自己好好研究研究他们的要求。下面这个pdf文件介绍了所有的关键词(有些你不需要)。
ftp://ftp.iucr.org/cifdics/cif_pd_1.0.1.dic.pdf

下面这个网页有模板。我想你应该已经看过了。
http://www.iucr.org/iucr-top/cif/pd/index.html
7楼2007-11-08 20:57:16
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wsoso

木虫 (正式写手)

velapandou
谢谢你,我想应该是可以了.我试试吧,工作量好大啊,要把每个点的数据都编上去..往后可能还会向你请教.
我让版主转10个金币给你
8楼2007-11-09 19:22:52
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velapandou

铁虫 (小有名气)

推荐一个文本编辑软件ultraedit。可以竖着编辑。网上有的, 自己找。结合excel,你那个粉末数据cif文件应该在2分钟内完成。赫赫。
9楼2007-11-09 22:57:23
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wsoso

木虫 (正式写手)

velapandou
你能给我举个例子说明怎么编辑吗?谢谢你了!10个金币已经让版主给你了,从我这里扣
10楼2007-11-12 18:59:38
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