应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 氢键催化双分子Diels-Alder反应，应选用哪种基组和方法？
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 1534  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

schalke

专家顾问

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！

[求助] 氢键催化双分子Diels-Alder反应，应选用哪种基组和方法？

glu、tyr残基形成氢键催化双分子Diels-Alder反应，需要进行底物复合物几何优化与过渡态结构优化得到精确构型并计算反应活化能，整个体系有92个原子。请问哪种基组和方法比较合适呢？参考文献使用的是b3lyp 6-31G+(d,p)。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-07-09 09:32:41
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

schalke

超级版主

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
引用回帖:
4楼: Originally posted by 亍寞 at 2013-07-10 11:27:52
咱以前算过的时候用的是b3lyp 6-31G+(d) 记得当初单从结果上来看，没觉得有多大差别，嘛。。。不过如果计算条件好，不如一次到位。。。。。顺便麻烦lz说下参考文献的号？

因为要设计氨基酸残基，所以必须追求残基与反应过渡态的精确构型，并计算有无残基的活化能的差异。所以希望找到一种计算含氢键构型与活化能都比较好的方法。参考文献是computational design of an enzyme catalyst for a stereoselective bimolecular diels-alder reaction

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下 回复此楼
6楼2013-07-10 16:06:22
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

xzz1007

专家顾问

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
我之前算过DA反应，但也就二十几个原子，不超过三十，使用的是b3lyp/6-311G++(d,p)优化，mp2/6-311G++(d,p)计算的能量。
赞一下 回复此楼
阳光总在风雨后，再坚持坚持吧.....
2楼2013-07-09 13:41:32
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

亍寞

实习版主

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
schalke: 金币+10, ★有帮助 2013-07-10 15:51:54
咱以前算过的时候用的是b3lyp 6-31G+(d) 记得当初单从结果上来看，没觉得有多大差别，嘛。。。不过如果计算条件好，不如一次到位。。。。。顺便麻烦lz说下参考文献的号？
赞一下 回复此楼
4楼2013-07-10 11:27:52
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

schalke

主管区长

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
引用回帖:
2楼: Originally posted by xzz1007 at 2013-07-09 13:41:32
我之前算过DA反应，但也就二十几个原子，不超过三十，使用的是b3lyp/6-311G++(d,p)优化，mp2/6-311G++(d,p)计算的能量。

谢谢，很有帮助！我最近查文献，都说b3lyp 对弱相互作用计算很烂，我这种情况需要计算氢键结合稳定过渡态，是不是用m06-2x更好一些？但不知道时间上会不会太久？

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下 回复此楼
5楼2013-07-10 15:56:13
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料调剂 +10 Eujd1 2026-03-31 11/550 2026-04-01 11:23 by ivanqyq
[考研] 358求调剂 +3 王向阳花 2026-03-31 3/150 2026-04-01 09:56 by zzchen2000
[考研] 求0861交通运输专硕or材料专硕调剂 +4 勒布朗@ 2026-03-31 4/200 2026-04-01 09:54 by 一只好果子?
[考研] 【调剂】一志愿厦大生物与医药调剂 +3 Echo虾米 2026-03-31 3/150 2026-04-01 08:40 by JourneyLucky
[考研] 调剂推荐 +7 清酒714 2026-03-26 8/400 2026-03-31 22:12 by 544594351
[考研] 289求调剂 +7 BrightLL 2026-03-29 7/350 2026-03-31 22:05 by 544594351
[论文投稿] chinese chemical letters英文版投稿求助 120+4 Yishengeryi 2026-03-30 4/200 2026-03-31 19:52 by babero
[考研] 353求调剂 +3 江上枫_26 2026-03-28 3/150 2026-03-31 15:53 by jp9609
[考研] 289求调剂 +3 Acesczlo 2026-03-29 4/200 2026-03-31 14:48 by 热情沙漠
[考研] 085404 22408 315分 +5 zhuangyan123 2026-03-31 6/300 2026-03-31 13:48 by limeifeng
[考研] 085601一志愿中山大学深圳材料工程330求调剂 +5 pipiver 2026-03-30 5/250 2026-03-31 07:37 by JourneyLucky
[考研] 食品工程专硕一志愿中海洋309求调剂 +5 小张zxy张 2026-03-26 10/500 2026-03-31 00:29 by jp9609
[考研] 303求调剂 +7 DLkz1314. 2026-03-30 7/350 2026-03-30 21:07 by peike
[考研] 11408总分309，一志愿东南大学求调剂，不挑专业 +5 天赋带到THU 2026-03-29 6/300 2026-03-30 20:49 by dick_runner
[考研] 105500药学求调剂，一志愿山东大学药学，348分 +3 gr哈哈哈 2026-03-28 3/150 2026-03-30 18:56 by 源_2020
[考研] 材料化工340求调剂 +3 jhx777 2026-03-30 3/150 2026-03-30 17:54 by JourneyLucky
[考研] 343求调剂085601 +3 要努力学习x 2026-03-29 3/150 2026-03-29 18:35 by wxiongid
[考研] 一志愿双一流机械285分求调剂 +4 幸运的三木 2026-03-29 5/250 2026-03-29 14:49 by Miko19
[考研] 求调剂 +6 芦lty 2026-03-25 7/350 2026-03-28 13:13 by 唐沐儿
[考研] 0703化学求调剂，各位老师看看我！！！ +5 祁祺祺 2026-03-25 5/250 2026-03-27 21:44 by 东方猪猪
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭