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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 请求牛人帮助解答GALAHAD药效团结果分析问题
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yfanzxj

新虫 (初入文坛)

[求助] 请求牛人帮助解答GALAHAD药效团结果分析问题 已有1人参与

我在建模过程中得到以下结果，但是遇上了几个问题，请求牛人解答：
1。在MODEL_012中，FEATS值为8，为什么我在sybyl中看模型时，只看到7个药效团？药效团数量数量只和N_HITS的值一致？
2。HBOND值的解释，bookshelf中只有一句话，The pharmacophoric concordance，这值是越大越好还是越小越好？
请求牛人帮助解答GALAHAD药效团结果分析问题
GALAHAD结果分析.jpg
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1楼 2013-07-07 15:08:50
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xiaoxuancao

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

好久的帖子了，不知道楼主问题解决了没，我最近也在用galahad做药效团，结果里面的FEATS值是指产生的药效特征的数量，与N-hits无关，只看到7个可能是两个特征重合了，可以通过PMA观察每个feature，N-hits是指你用来生成药效团的活性化合物的数量。
HBOND越大越好，5,6,7列值可以用来分析药效团模型，ENERGY越小， STERIC ，HBOND越大，模型越好
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jine914
2楼2014-06-20 14:29:06
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jine914

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by xiaoxuancao at 2014-06-20 14:29:06
好久的帖子了，不知道楼主问题解决了没，我最近也在用galahad做药效团，结果里面的FEATS值是指产生的药效特征的数量，与N-hits无关，只看到7个可能是两个特征重合了，可以通过PMA观察每个feature，N-hits是指你用来 ...

请问用7种商品化药剂建立的药效团为什么这7种商品化药剂筛选不出来呢，100个化合物的测试集中倒是筛选出一个化合物，这是什么原因
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3楼2017-08-25 10:54:17
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