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用AMBER之前对核酸PDB处理的问题
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我才刚刚接触AMBER和VMD,看到网上说用AMBER之前要对核酸PDB文件进行处理,把里面的水分子要去除掉,可是为什么在用文本格式对PDB文件中的水分子以及突变体进行删除和修正之后,用VMD打开PDB结构,就无故出现了许多之前没有的键了,而且导入AMBER中就说有Illegal CONECT record in pdb file 这要怎么继续处理?有没有哪位高手指点一下,最近对这个问题很头痛啊?谢谢! |
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