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yang22181

木虫 (正式写手)


[资源] 刚刚找到,与大家分享BandScan5.0

刚刚找到,与大家分享
使用迅雷,新建任务:http://www.seekbio.com/down.asp?id=254&no=1
下载BandScan5.0
破解程序在附件
使用方法网上随处可down
如果找不到,告诉我,Email给你word版


我的56邮箱共享中全有,yang22181@56.com

[ Last edited by yang22181 on 2007-10-25 at 11:47 ]
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qgaoamtf

至尊木虫 (职业作家)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

Super! Sehr gut!
6楼2008-10-07 00:47:08
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yang22181

木虫 (正式写手)


★ ★
lwf991229(金币+2,VIP+0):很好,很详细...
Bandscan 5.0 安装说明(pinghw提供)(无图

双击

解压缩到指定文件夹,找到 图标,双击后按提示进行安装,系统默认安装在c:\program file\Glyko\Banscan文件夹中,安装完成后将patch文件(即 )复制到c:\program file\Glyko\Banscan文件夹中,双击 ,点击patch即可。


Bandscan 5.0 使用说明(由palmyard战友提供)

1.        安装好以后就会在桌面上出现BandScan的图标。双击打开。

2.        打开后的界面如图。

3.        打开一张扫描好的电泳图。BandScan可以识别TIF和JPG格式的图片,很方便。打开工具栏上的file/open tiff,jpg file format,选中待分析的图片。

4.        打开。这时候凝胶图像显示出来。1道是低分子量标准,2道是诱导表达的蛋白,3道是未诱导的对照。旁边有一个图像预览窗口Image Preview,可以看到,除了cancal,其它命令框都是灰色的(不可操作)。其实这里是要你先选定一个图像处理的范围(select rectangle)。

5.        从凝胶图左上角按住鼠标左键划到右下角,松开鼠标,划出的长方形框包扩了整个待分析的范围。这时,命令框内均变成黑色的(可以操作)。上面那个undo rect可以取消选框,下面的image options可以选择是否和如何旋转图像。本例中均不改动,直接单击accept selected region。

6.        出现color to signal selections复选框。这个是选择信号检测方式,直接用默认的original image,或选择gray scale(灰阶)。本例中不改动,单击use current image。

7.        出现如下分析框。它是自动转换成灰阶的。其左上角的数字是鼠标所在的坐标和灰度值。移动鼠标就可以看到它的变化。


8.        现在让BandScan来分析一下电泳条带吧:)打开工具栏上的band finding/find bands,出现一个让你选择有几条泳道的框selecting number of lanes,我们设置成3道。











9.        看,每一个条带都自动被框起来了:)红色+记号是条带的中心位置,兰色竖线是泳道位置。同时出现了一个复选框select more or select few bands。可以根据总灰度、最大灰度和大小为标准来自动选择蛋白条带。拉动左边的滚动条,可以增加或减少条带的数量。选好后单击ok。













10.        现在就可以看看蛋白的表达量了。打开window/band table。出现了一个band location的表格。把它最大化,放到右边。这里的数据是每个条带的中心位置(红色+的位置)。














11.        在band location的数据类型data type中,选择percent signal,就会出现各个条带灰度值占本泳道条带总灰度值的百分比。














12.        单击自己的表达条带,则条带中心的+和相应的百分数的背景都会变成绿色。我表达的融合蛋白约占细菌总蛋白的29.8%。我们要的数据就得到了。自己再重复一下整个过程,会发现,原来是如此简单:)


总结:真的只是领进门。因为BandScan绝不仅仅是这么简单,它还可以做很多事情。比如通过设定一个条带的量(标准)来推断表达蛋白的量。比如用手动方式加入未被自动选择的条带,等等。举个例,我们发现我的目的条带上面有几个浅条带没有被选上,可以用band finding/manually insert a band命令把它们选上。这时,条带百分数也会随之改变。

[ Last edited by yang22181 on 2007-10-25 at 11:50 ]
2楼2007-10-25 11:49:15
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香菱儿

铁杆木虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

Very good! Thank you very much for sharing it!
4楼2007-10-26 07:21:43
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leileiwang

铜虫 (小有名气)


楼主,能不能把这个软件发给我啊。我从迅雷上下不下来,急死我了。谢谢啦!
leileiwang@yahoo.cn
急需,急需,万分感谢!
5楼2008-10-06 21:16:03
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