应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » NBO/AIM » NBO计算中氢键的二阶微扰稳定化能大小的问题
81/1返回列表
查看: 2259  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

wozecheng

金虫 (小有名气)

[求助] NBO计算中氢键的二阶微扰稳定化能大小的问题

我用NBO计算阴阳离子体系中的氢键，O-H距离为1.9埃，键角为152°，E（2）LPO→BD*C-H 的值约为2.5kcal/mol，其他氢键更弱，二阶微扰稳定化能不到1kcal/mol，重要的是我计算的阴阳离子两者之间的相互作用达到了150kcal/mol。
不解的是二阶微扰稳定化能与相互作用能差别应在一个数量级上吗？本人计算的NBO出错了，还是H键并非决定了相互作用，阴阳离子间的电荷作用占主要的？
求指点，量化小白谢谢各位、、、
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-07-03 21:33:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

loovfnd

至尊木虫 (著名写手)
★
gkf高: 金币+1 2013-07-04 16:11:40
这个我也不太确定啊.就是计算这个微扰，可以调节一个参数。试试改改这个参数或许有帮助
赞一下 回复此楼
莫强求！
2楼2013-07-04 16:04:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhou2009: 金币+3 2013-07-04 20:13:27
wozecheng: 金币+10, ★★★很有帮助 2013-07-04 22:09:58
NBO给出的E2根本不能用来衡量分子间总相互作用能的强弱，不仅在定量上根本不准，在定性上甚至都说明不了问题。E2分析只能定性地反映相互作用能中的轨道相互作用的大小。像是范德华作用为主导、静电作用为主导的情况，光靠E2分析显然不合适。总之不要把E2值太当回事。
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2013-07-04 18:51:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wozecheng

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by loovfnd at 2013-07-04 16:04:33
这个我也不太确定啊.就是计算这个微扰，可以调节一个参数。试试改改这个参数或许有帮助

谢谢你的回复，应该改哪个参数呀？
赞一下 回复此楼
4楼2013-07-04 22:06:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wozecheng

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by sobereva at 2013-07-04 18:51:05
NBO给出的E2根本不能用来衡量分子间总相互作用能的强弱，不仅在定量上根本不准，在定性上甚至都说明不了问题。E2分析只能定性地反映相互作用能中的轨道相互作用的大小。像是范德华作用为主导、静电作用为主导的情况 ...

谢谢sobereva老师回复，但我看其他文献如：J. Phys. Chem. B 2008, 112, 5088-5097，此文献是离子液体中阴阳离子的相互作用，主要讨论了氢键的影响，而对氢键的分析主要为AIM和NBO，我的体系与其类似，但离子复杂，还含有过渡金属。他的体系中H键的E2快达到相互作用能的一半了，E2讨论应还有意义。我计算的AIM结果显示有H键，但NBO计算E2很小，两者产生矛盾。。。该如何讨论自己体系里阴阳离子间的H键呢？若非H键对其影响，其怎样达到能量最低构型呢？这种以范德华作用为主导、静电作用为主导的情况，真心不知如何研究了。。
赞一下 回复此楼
5楼2013-07-04 22:38:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
gkf高: 金币+3 2013-07-05 00:38:17
wozecheng: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-07-05 09:19:14
E2快达到相互作用能的一半说明不了什么。E2本来就不是个准确的量，物理意义也并不严格，和总相互作用能我不认为有什么可比性。顶多能讨论一些趋势性的问题（比如几种同类物质结合能大小不同，可以借助E2探究导致相对大小差异的原因）。更何况氢键本身就是以静电作用为主导的，NBO分析完全夸大了轨道相互作用的地位。
能够讨论弱相互作用的方法很多，在《Multiwfn 3.0波函数分析程序的意义、功能与用途》（http://hi.baidu.com/sobereva/item/b35581418db96cea1f19bc09）文中5.4节就有比较全面的列举。也可以通过能量分解来讨论。
赞一下 回复此楼
6楼2013-07-04 23:29:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

夏天的娃

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wozecheng: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢提供的文献哦 2013-07-05 09:19:55
引用回帖:
5楼: Originally posted by wozecheng at 2013-07-04 22:38:25
谢谢sobereva老师回复，但我看其他文献如：J. Phys. Chem. B 2008, 112, 5088-5097，此文献是离子液体中阴阳离子的相互作用，主要讨论了氢键的影响，而对氢键的分析主要为AIM和NBO，我的体系与其类似，但离子复杂， ...

这个E2不一定与相互作用能呈正相关关系，可见有关离子液体的这篇文章J. Phys. Chem. B, 2012, 116 (3), pp 1007–1017；
另外LZ 说的E（2）LPO→BD*C-H ，其中LP(O)有将几个不同方向的long pair 的O轨道的E(2)加和么？

小虫拙见，共同学习。
赞一下 回复此楼
7楼2013-07-04 23:30:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wozecheng

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 夏天的娃 at 2013-07-04 23:30:02
这个E2不一定与相互作用能呈正相关关系，可见有关离子液体的这篇文章J. Phys. Chem. B, 2012, 116 (3), pp 1007–1017；
另外LZ 说的E（2）LPO→BD*C-H ，其中LP(O)有将几个不同方向的long pair 的O轨道的E(2)加和 ...

已经加过了，很小。。。
回复此楼
8楼2013-07-05 09:59:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wozecheng 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭