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wozecheng

金虫 (小有名气)

[求助] NBO计算中氢键的二阶微扰稳定化能大小的问题

我用NBO计算阴阳离子体系中的氢键,O-H距离为1.9埃,键角为152°,E(2)LPO→BD*C-H 的值约为2.5kcal/mol,其他氢键更弱,二阶微扰稳定化能不到1kcal/mol,重要的是我计算的阴阳离子两者之间的相互作用达到了150kcal/mol。
不解的是二阶微扰稳定化能与相互作用能差别应在一个数量级上吗?本人计算的NBO出错了,还是H键并非决定了相互作用,阴阳离子间的电荷作用占主要的?
求指点,量化小白谢谢各位、、、
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loovfnd

至尊木虫 (著名写手)


gkf高: 金币+1 2013-07-04 16:11:40
这个我也不太确定啊.就是计算这个微扰,可以调节一个参数。试试改改这个参数或许有帮助
莫强求!
2楼2013-07-04 16:04:33
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhou2009: 金币+3 2013-07-04 20:13:27
wozecheng: 金币+10, ★★★很有帮助 2013-07-04 22:09:58
NBO给出的E2根本不能用来衡量分子间总相互作用能的强弱,不仅在定量上根本不准,在定性上甚至都说明不了问题。E2分析只能定性地反映相互作用能中的轨道相互作用的大小。像是范德华作用为主导、静电作用为主导的情况,光靠E2分析显然不合适。总之不要把E2值太当回事。
3楼2013-07-04 18:51:05
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wozecheng

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by loovfnd at 2013-07-04 16:04:33
这个我也不太确定啊.就是计算这个微扰,可以调节一个参数。试试改改这个参数或许有帮助

谢谢你的回复,应该改哪个参数呀?
4楼2013-07-04 22:06:04
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wozecheng

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by sobereva at 2013-07-04 18:51:05
NBO给出的E2根本不能用来衡量分子间总相互作用能的强弱,不仅在定量上根本不准,在定性上甚至都说明不了问题。E2分析只能定性地反映相互作用能中的轨道相互作用的大小。像是范德华作用为主导、静电作用为主导的情况 ...

谢谢sobereva老师回复,但我看其他文献如:J. Phys. Chem. B 2008, 112, 5088-5097,此文献是离子液体中阴阳离子的相互作用,主要讨论了氢键的影响,而对氢键的分析主要为AIM和NBO,我的体系与其类似,但离子复杂,还含有过渡金属。他的体系中H键的E2快达到相互作用能的一半了,E2讨论应还有意义。我计算的AIM结果显示有H键,但NBO计算E2很小,两者产生矛盾。。。该如何讨论自己体系里阴阳离子间的H键呢?若非H键对其影响,其怎样达到能量最低构型呢?这种以范德华作用为主导、静电作用为主导的情况,真心不知如何研究了。。
5楼2013-07-04 22:38:25
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
gkf高: 金币+3 2013-07-05 00:38:17
wozecheng: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-07-05 09:19:14
E2快达到相互作用能的一半说明不了什么。E2本来就不是个准确的量,物理意义也并不严格,和总相互作用能我不认为有什么可比性。顶多能讨论一些趋势性的问题(比如几种同类物质结合能大小不同,可以借助E2探究导致相对大小差异的原因)。更何况氢键本身就是以静电作用为主导的,NBO分析完全夸大了轨道相互作用的地位。
能够讨论弱相互作用的方法很多,在《Multiwfn 3.0波函数分析程序的意义、功能与用途》(http://hi.baidu.com/sobereva/item/b35581418db96cea1f19bc09)文中5.4节就有比较全面的列举。也可以通过能量分解来讨论。
6楼2013-07-04 23:29:25
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夏天的娃

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wozecheng: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢提供的文献哦 2013-07-05 09:19:55
引用回帖:
5楼: Originally posted by wozecheng at 2013-07-04 22:38:25
谢谢sobereva老师回复,但我看其他文献如:J. Phys. Chem. B 2008, 112, 5088-5097,此文献是离子液体中阴阳离子的相互作用,主要讨论了氢键的影响,而对氢键的分析主要为AIM和NBO,我的体系与其类似,但离子复杂, ...

这个E2不一定与相互作用能呈正相关关系,可见有关离子液体的这篇文章J. Phys. Chem. B, 2012, 116 (3), pp 1007–1017;
另外LZ 说的E(2)LPO→BD*C-H ,其中LP(O)有将几个不同方向的long pair 的O轨道的E(2)加和么?

小虫拙见,共同学习。
7楼2013-07-04 23:30:02
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wozecheng

金虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 夏天的娃 at 2013-07-04 23:30:02
这个E2不一定与相互作用能呈正相关关系,可见有关离子液体的这篇文章J. Phys. Chem. B, 2012, 116 (3), pp 1007–1017;
另外LZ 说的E(2)LPO→BD*C-H ,其中LP(O)有将几个不同方向的long pair 的O轨道的E(2)加和 ...

已经加过了,很小。。。
8楼2013-07-05 09:59:57
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