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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » NBO/AIM » 【求助】NBO计算氢键
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huying15

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】NBO计算氢键 已有3人参与

用NBO研究氢键时，得到的E2，如下：
348. LP (   1) O   8                /***. BD*(   1) C 113 - H 212            0.18
349. LP (   2) O   8                /***. BD*(   1) C 113 - H 212            0.22
原子都是相同的，我应该选哪个
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1楼 2010-09-06 09:50:13
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calfwoo

金虫 (小有名气)
huying15(金币+2): 2010-09-06 14:32:39
可能你的C-H正对着-O-的两对孤对电子中间？
如果是，那两个都要算。
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2楼2010-09-06 11:01:53
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huying15

铜虫 (小有名气)
怎么看C-H是否正对着-O-的两对孤对电子中间，还有就是如果这样的话，E2该怎么算，是加起来吗
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3楼2010-09-06 14:34:52
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calfwoo

金虫 (小有名气)
huying15(金币+3): 2010-09-07 09:50:09
1, O是C=O的情况，H与之呈接近直线型。
2, O是醇羟基或醚键的，H近似处在R-O-R角的平分线上。

这两种情况，是要加起来算E2的吧。
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4楼2010-09-07 09:48:59
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huying15

铜虫 (小有名气)
哦，我的好像是羰基，看来要加起来了，谢谢哦
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5楼2010-09-07 09:50:43
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huying15

铜虫 (小有名气)
如果氧是环糊精糖苷键上的氧，还是有LP (   1) 和  LP (   2) ，该怎么算E2
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6楼2010-09-11 22:47:10
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)
★ ★
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yjcmwgk(金币+1): 2010-09-24 22:13:44
楼主这种情况不能认为O的LP对C-H的反键有轨道相互作用，E2太太太小了。。。
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Anewday,anewhour,anewminute,anewpeople.
7楼2010-09-12 08:42:44
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huying15

铜虫 (小有名气)
也就是说不是氢键了，是吧
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8楼2010-09-12 20:25:51
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lqzdonald

木虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+1): 2010-09-24 22:13:57
那不一定，这个值很小，只是说明了超共轭作用很小，也就是说其在氢键形成中的贡献很小。
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9楼2010-09-22 16:40:10
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huying15

铜虫 (小有名气)
谢谢哦，我再问下，我所得的E2如下，我想问下该怎么算
E2
LP (   1) O  51                /***. BD*(   1) C   1 - H  12     0.14
LP (   2) O  51                /***. BD*(   1) C   1 - H  12     0.09
O51全甲基β-环糊精糖苷单元上甲氧基上的氧
LP (   1) O  30                /***. BD*(   1) C   3 - H  15            0.17   
LP (   2) O  30                /***. BD*(   1) C   3 - H  15            0.15
O30是全甲基β-环糊精的糖苷氧，我想问下E2该怎么计算
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10楼2010-09-24 12:53:08
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