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Ag体内做vc-relax出错，不知怎样改参数？
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自己做了Ag原子的赝势，想测试下VC-relax的晶格常数变化大不大。可是有些错误，不知道怎么样修改参数。 &control calculation='vc-relax' restart_mode='from_scratch', pseudo_dir = '/', outdir='/', prefix='Ag' / &system ibrav= 2, celldm(1) =7.7290 nat=1, ntyp=1, ecutwfc =45 occupations='smearing', smearing='methfessel-paxton', degauss=0.04 / &electrons mixing_beta = 0.4 mixing_ndim =12 conv_thr = 1.0d-8 diagonalization ='cg' / &ions upscale=10 / &CELL cell_dynamics = 'bfgs' , press = 0.00 , cell_dofree='xyz', / ATOMIC_SPECIES Ag 107.9 Ag.rel-pbe.newUPF ATOMIC_POSITIONS Ag 0.00000000 0.00000000 0.00000000 K_POINTS (automatic) 8 8 8 0 0 0 输出结果： CELL_PARAMETERS (alat= 7.72900000) -0.507305951 0.003652975 0.496347025 -0.003652975 0.507305951 0.496347025 -0.503652975 0.503652975 -0.007305951 ATOMIC_POSITIONS (alat) Ag 0.000000000 0.000000000 0.000000000 %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% from checkallsym : error # 2 not orthogonal operation %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% |
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谢谢各位。cell_dofree='all' 测试过是可行的。我后来想了一下，把Ag体内的原胞取成了简单立方ibrav=1 ， ATOMIC_POSITIONS Ag 0.00000000 0.00000000 0.00000000 Ag 0.50000000 0.50000000 0.00000000 Ag 0.00000000 0.50000000 0.50000000 Ag 0.50000000 0.00000000 0.50000000 能正常运行，输出结果： CELL_PARAMETERS (alat= 7.72900000) 1.024584086 0.000000000 0.000000000 0.000000000 1.024584086 0.000000000 0.000000000 0.000000000 1.024584086 基矢变了，说明晶格常数也变了，变化后的应该是7.729*1.024584086，不知道这样是否有问题？ |
8楼2013-07-05 10:14:13
chuanghua304
禁虫 (职业作家)
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sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2013-07-04 10:06:37
sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2013-07-04 10:06:37
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2楼2013-07-02 14:34:58
valenhou001
至尊木虫 (职业作家)
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
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sunyang1988: 应助指数+1 2013-07-04 10:07:05
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楼主的基矢（CELLDM和IBRAV)和原子坐标设置都是合适的，因为计算的是fcc的Ag原胞。 出现这样的错误，是vc-relax计算时最常见的，由于对称性检查的问题。 你可试试改用 ibrav=0,另外手动设置初始的fcc的晶格基矢在输入文件中： CELL_PARAMETERS {alat} -0.507305951 0.003652975 0.496347025 -0.003652975 0.507305951 0.496347025 -0.503652975 0.503652975 -0.007305951 你要计算晶格常数的话，还是最好按计算一组“晶格常数--总能”的数据之后进行拟合得到最优的晶格常数，这样的方式来做。 |
3楼2013-07-02 16:01:47
souledge
专家顾问 (著名写手)
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【答案】应助回帖
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sunyang1988: 金币+1, 专家考核, 谢谢交流 2013-07-04 10:07:36
感谢参与，应助指数 +1
sunyang1988: 金币+1, 专家考核, 谢谢交流 2013-07-04 10:07:36
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因为FCC的Primitive Cell的a, b, c三轴的夹角为60度，而不是90度，所以当LZ使用&cell下的cell_dofree = 'xyz'时，就是固定了三个角度，就会出现角度不正交的毛病。 换句话说，想要固定角度， 除非是三个90度角，否则在QE中就会出现正交错误，并在第一个SCF后结束vc-relax的计算。当然，是否有方法克服这个直接设置cell_dofree的问题，个人暂时不清楚。所以这并不表示QE就一定不能固定至少有一个非90的角。 |
4楼2013-07-02 18:34:30
