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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 如何用Materials-studio画金属有机配合物，并且测定配位键间的夹角
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060842

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何用Materials-studio画金属有机配合物，并且测定配位键间的夹角 已有1人参与

Sample Text用MS中skech atom及skech ring键画出金属有机配合物（见图），加氢并且clean后，发现金属原子与配位原子间夹角几乎全为90度，即金属原子是平面四边形结构。
但实际上金属原子是正四面体结构，四个配体位于四面体的四个顶点，金属原子位于体心。
问题：1、金属有机配合物应该怎么画？
2、如何测定金属有机配合物中螯合角（即图中所标夹角）？
如何用Materials-studio画金属有机配合物，并且测定配位键间的夹角
ms.jpg
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1楼 2013-06-29 12:27:17
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060842

新虫 (初入文坛)
自己顶一个
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2楼2013-06-29 23:00:19
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stalart

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流，， 2013-07-01 23:52:53
金属有机配合物一般不是自己画的，而是用cif文件改的。MS有专门的角度测量，面板上就有
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3楼2013-06-30 20:55:10
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ZTB爱化学

银虫 (正式写手)
不懂，帮顶下
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好好科研
4楼2013-07-01 23:06:36
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漂泊四方

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

但实际上金属原子是正四面体结构，四个配体位于四面体的四个顶点，金属原子位于体心。
问题：1、金属有机配合物应该怎么画？
2、如何测定金属有机配合物中螯合角（即图中所标夹角）？

你做出来的结构是平面结构而不是正四面体结构是因为初始结构不合理，所以clean工具后自动弛豫到比较接近的局域能量最小结构。你可以用选择工具选择相应的基团，通过旋转工具，平移工具把初始结构调整到四面体结构，操作不难，选中你金属下面两个有机体，旋转90度就可以了，之后再进行clean,多次操作会得到你的结构 。

角度测量，有专用工具 distance, angle ,torsion 都可以直接测量。
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我与我纠缠久
5楼2013-07-02 17:24:23
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毕文柱

铁杆木虫 (正式写手)

本科

【答案】应助回帖

我也是新手，不过我觉着，要是有一个学习教程就比较完美了~~~
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稳稳地加油！！！
6楼2013-10-19 09:09:35
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wjslsd

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

楼主，会画金属有机物呢？菜鸟，求助。。。
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1111
7楼2015-12-08 19:15:34
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