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chen0mao

木虫 (职业作家)

[求助] 想知道一个分子的大小,大概的体积,长宽高多少nm?

没接触过这方面,做实验用到一个分子,想知道它具体大概的尺寸,数量级在哪个范围,都说可以用高斯优化后计算,但是高斯不会用,请达人帮忙算下!想知道一个分子的大小,大概的体积,长宽高多少nm?
tanic acid.gif[ Last edited by chen0mao on 2013-6-28 at 09:53 ]
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  • 2013-06-28 09:53:00, 664.91 K

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chuntao118

新虫 (著名写手)

通过物质的密度和分子数直接计算也能得到吧?
10楼2015-07-09 11:01:14
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普通回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你有这个分子的坐标文件吗?
如果有的话,就非常简单,不用算,导入到VMD 中然后输入命令:

set all [atomselect top all]
set minmax [measure minmax $all]

这样就得到了大概的范围
2楼2013-06-28 10:37:04
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chen0mao

木虫 (职业作家)

内容已删除
3楼2013-06-28 15:09:23
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997884095

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 赞,此法可行! 2013-06-28 16:20:32
搞到chemdraw里面3D模型,量下就知道大概尺度了

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2013-06-28 15:59:23
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ckm840529

铁杆木虫 (著名写手)

I love science!

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2013-06-30 08:21:21
大概体积数量级估计在10 nm^3左右啦。至于长宽高要看分子的构象啦!
行胜于言!科学求真,社会求善,艺术求美!
5楼2013-06-29 08:31:55
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chen0mao

木虫 (职业作家)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 997884095 at 2013-06-28 15:59:23
搞到chemdraw里面3D模型,量下就知道大概尺度了

chem 3D里面那个太不准了!
6楼2013-06-29 10:22:56
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chen0mao

木虫 (职业作家)

引用回帖:
5楼: Originally posted by ckm840529 at 2013-06-29 08:31:55
大概体积数量级估计在10 nm^3左右啦。至于长宽高要看分子的构象啦!

这个是怎么估计出来的,算键长和原子大小的累加?
7楼2013-06-29 10:26:22
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ckm840529

铁杆木虫 (著名写手)

I love science!

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by chen0mao at 2013-06-29 10:26:22
这个是怎么估计出来的,算键长和原子大小的累加?...

算C-C键长,0.154nm。
行胜于言!科学求真,社会求善,艺术求美!
8楼2013-06-29 10:37:26
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wangmingqi

木虫 (正式写手)

荣誉主席

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 997884095 at 2013-06-28 15:59:23
搞到chemdraw里面3D模型,量下就知道大概尺度了

请问具体是怎么操作的?使用MM2计算的?谢谢!
老婆是根本
9楼2015-06-30 15:19:58
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