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秋雨心寒

铜虫 (初入文坛)

[求助] solid 5500xl 运行之后数据处理

我们实验室购置了一台solid 5500xl,现在前期生物实验部分还算比较成功,目前数据都已经运行成功,且经过服务器运算处理完成。但是对于手上得到的数据却无从下手,不知道该怎么处理这些数据。向各位大侠们求助一下可以处理这些数据的软件有哪些?运行算法什么的有啥推荐没有?不然手上拿着这些数据丝毫用处没有,毕业无望啊~~~~~~~~~感谢大侠们~~~~
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gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
秋雨心寒(myprayer代发): 金币+1, Gifts of roses, hand there are lingering fragrance. Look forward to your wonderful and more detailed answer. 2013-06-27 08:46:55
你现在的数据格式是什么?
测的什么样品?RNA还是DNA?
通量、覆盖度、读长都多少?
2楼2013-06-26 21:28:07
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秋雨心寒

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gaoyang636 at 2013-06-26 21:28:07
你现在的数据格式是什么?
测的什么样品?RNA还是DNA?
通量、覆盖度、读长都多少?

数据格式都是txt,人的全血DNA外显子,读长75bp,95%cover
3楼2013-06-27 12:25:27
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gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

你这个实验目的是啥?
另外,txt也不能叫数据格式吧…… 我其实想问你这个是序列文件?是VCF文件?还是啥子
4楼2013-06-27 14:22:42
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