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在集群上如何算CASTEP 能带、态密度
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| 在集群上已经把结构优化了，接下来提交作业计算能带和态密度，成功算完后却无法查看能带和态密度图。我想是缺少相应的.castep文件。请教各位大侠，帮帮我啊。计算能带的作业脚本怎么写啊？它和优化时的脚本有什么区别？先谢谢了。很急啊 |
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sunyang1988: 金币+2, 谢谢帮助 2013-07-04 10:12:43
sunyang1988: 金币+2, 谢谢帮助 2013-07-04 10:12:43
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我想可能是你提交的时候，没有提交A_Bandstr.cell 和A_DOS.cell，这两个文件名，也就是在PBS脚本里的Project name=这项后面需要修改为A_Bandstr或者A_DOS，其中A可以自己设置，我们学校的集群上就是这样的，我前几天一直无法计算光学性能，后来才发现是这个问题，同时附一个PBS脚本给你，希望你能有用，我们学校用的是MS6.0版本的，你可以根据实际情况修改 PBS脚本如下： #!/bin/bash #PBS -N castep #PBS -l nodes=2:ppn=4 #PBS -l walltime=3000:00:00 #PBS -j oe project_name=AlC source /public/software/intel/impi/4.0.0.025/intel64/bin/mpivars.sh source /public/software/Accelrys/ms60-env.sh cd $PBS_O_WORKDIR NP=`cat ${PBS_NODEFILE} | wc -l` $MS_INSTALL_ROOT/bin/mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NP $MS_INSTALL_ROOT/bin/castepexe.exe $project_name rm -f *.pid exit 0 |
4楼2013-07-02 18:30:27
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