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spritesu

银虫 (正式写手)

[求助] 甲基化思路

想请教各位做甲基化的大侠 大家做甲基化都是什么思路啊?
我知道这问题有点大 但是偶想听听各种思路
基于高通量测序的甲基化是什么思路
分子实验的甲基化是什么思路
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spritesu
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by spritesu at 2013-06-17 13:45:19
结合转录组 是不是会更好、
与近缘物种比 有意义吗...

可以做基因表达谱分析,那就是从转录本角度做的;也可以结合蛋白质组学研究。
11楼2013-06-17 23:08:33
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查看全部 17 个回答

晕月山江

金虫 (职业作家)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
请你找些相关文献 甲基化貌似生化课本上也有的,你2不2尽问些这种问题,唉。。。
2楼2013-06-16 11:09:48
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流,请问你是做表观遗传学的吗? 2013-06-16 16:01:43
myprayer: 金币+2, Gifts of roses, hand there are lingering fragrance. Look forward to your wonderful and more detailed answer. 2013-06-19 08:16:20
DNA甲基化的高通量测序的基本方法可以分为两大类:
1.非质谱方法:比如重亚硫酸盐测序方法检测DNAde甲基化;甲基化-敏感性单链构想分析;DNA的甲基化改变的变性梯度胶电泳;DNA的甲基化特异性寡核苷酸生物芯片分析,生物芯片分析也能够用于DNA测序等等。
2.质谱方法:测定DNA甲基化修饰之后的相对分子量变化,MS-MS既可以用测定多肽序列,也可以用于测定寡核苷酸序列,可以在测定甲基化特异性寡核苷酸序列前用限制性内切酶切开DNA,不含有修饰的DNA部分可直接用酶法和化学法测定,剩下的有修饰的部分DNA片段用MS-MS。

参考文献:
1.MMB 507-DNA methylation,which is one of Methods in Molecular Biology Series.http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6015850

2.John N. Abelson Melvin I. Simon ect .,Method in Enzymology Vol-402,Biological Mass Spectrometry,Elsevier Inc,2005.
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=5795342

专门讲核酸的质谱实验的书现在不在我手里。抱歉!
3楼2013-06-16 14:28:21
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spritesu

银虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 凌波丽 at 2013-06-16 14:28:21
DNA甲基化的高通量测序的基本方法可以分为两大类:
1.非质谱方法:比如重亚硫酸盐测序方法检测DNAde甲基化;甲基化-敏感性单链构想分析;DNA的甲基化改变的变性梯度胶电泳;DNA的甲基化特异性寡核苷酸生物芯片分析 ...

基于测序的甲基化研究 亮点是什么
spritesu
4楼2013-06-17 11:13:13
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