24小时热门版块排行榜

返回列表

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

lmcyjxs

金虫 (正式写手)

MolEPI: 1
应助: 17 (小学生)
金币: 1088.2
散金: 119
红花: 7
帖子: 954
在线: 124.3小时
虫号: 1255578
注册: 2011-04-05
性别: MM
专业: 中药资源

[求助] 大牛来指点下啊~CDS区到底含不含内含子？看了相关的帖反而把我搞糊涂了

各位大侠，我要崩溃了，不是说我没之前没看过帖，而是看了帖之后把我搞混了。
   1 CDS区到时含不含内含子？有一个老师说不含，一个说含，我看了论坛，两种说法我都好像看过。我认为是不含的。
   2 如果CDS区不含内含子，有些基因在NCBI里查到的，标题上注明是全长CDS区，但下面的注释里却显示含有很多个CDS区，基因序列也显示含有多个CDS区，如图1，难道CDS区真含有内含子才是正解？但为什么我克隆了一个基因，反转录得到的，不含内含子了，获得的基因就跟图1情况一样，终止密码子还更多，导致多个CDS区存在，怎么会这样呢？如图2
   3 若在一个基因序列里，含有多个CDS区（就是在多个不同位置含终止密码子），连接到表达载体是不是指翻译其识别的第一个CDS？

1.jpg

2.jpg

回复此楼

» 猜你喜欢

思路决定出路。。。

1楼 2013-06-14 16:15:35

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

凌波丽

专家顾问 (知名作家)

专家经验: +218
MolEPI: 44
应助: 397 (硕士)
贵宾: 0.044
金币: 2118.9
散金: 10
红花: 208
帖子: 5633
在线: 571.6小时
虫号: 1766465
注册: 2012-04-19
性别: MM
专业: 生物大分子结构与功能
管辖: 生物科学综合

补充：克隆基因与表达基因时也要对coding sequence和coding region加以注意。

因为真核细胞中的翻译后加工过程肯定比原核生物要复杂很多，所以有些的出现在编码区的终止密码子在真核细胞中会得到纠正，但是在原核细胞中可能无法纠正，导致表达失败。所以在构建载体时应该尽量不要让真核基因的编码区的终止密码子存在，构架基因时就应该加以修订，改变非终止。可以用软件大致模拟一下要表达的蛋白质（如果已有天然构象就不用做了），大致知道编码区的终止密码子存在与蛋白质什么位置，如果知道天然蛋白质的氨基酸序列就直接改成成熟的蛋白质的此位点的氨基酸的密码子，如果不知道知道天然蛋白质的氨基酸序列就直接改成成熟的蛋白质的此位点的氨基酸那么就改为其同一条肽链的同种构象部分的相邻氨基酸残基的同属性的氨基酸的密码子。
另外，有时数据库给出的编码区，未必就是真的编码区，可能就是全基因序列，包括5’-UTR,3’-UTR,intron和exon。你适当的多差一些数据库和原始论文。因为不少人对coding sequence和coding region不同的理解。

因为小木虫的帖子流动性非常大，所以我回答问题尽量完整，有些内容肯定会在不同的我回答的帖子中重复出现，但是这不是我要偷懒，而是这是我回答时认为的最好的答案。