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自己设计RNA建库用index primer（illumina）PCR扩增效率低
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针对RNA-seq，illumina官方公布的是24种index序列，实验室用的是NEB的RNA建库试剂盒，里面也只有24种index，现在这些index不够用，所以实验室自己合成了两个index primer（序列是根据small RNA建库试剂盒的index设计的）。 用同样的样本建库，在最后PCR扩增时比较试剂盒index和自合成index primer的扩增效率，发现自合成index primer的扩增效率总是很低，实验方法都一样，只是6个碱基的差别（index序列），为什么自合成index primer扩增总是低呢？ [ Last edited by gwzjiayou on 2013-6-14 at 15:18 ] |
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