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lp871

铁虫 (初入文坛)

[求助] 我在Linux下安装了GALAXY,但是里面的Tools需要自己装,不太会呀~~

大家好,本人菜鸟,在Linux系统下安装了GALAXY,但是装好之后里面的Tools需要自己装,比如SAMtools这些工具,我看了galaxy的官方网站,但还是不太懂,请各位大神给我指条明路啊~~~
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by lp871 at 2013-06-13 12:34:42
多谢啦,可不可以跟我简单说一下tool shed 和 wrapper可以在哪里找到相关的使用代码什么的?...

如果你真的是菜鸟的话,tool shed比较适合你,http://wiki.galaxyproject.org/Tool%20Shed。如果有编程基础的话,可以考虑自己写wrapper,http://wiki.galaxyproject.org/Admin/Tools/ToolConfigSyntax
4楼2013-06-13 17:35:14
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lp871: 金币+3, 有帮助 2013-06-13 12:35:37
如果你是根据http://wiki.galaxyproject.org/Admin/Get%20Galaxy来装的话,有很多工具是预装的,比如NGS:SAM tools,在我安装的版本下面有4个相关工具。如果没有你要的工具,可以考虑tool shed或者自己写wrapper。
2楼2013-06-13 04:22:12
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lp871

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wizardfan at 2013-06-13 04:22:12
如果你是根据http://wiki.galaxyproject.org/Admin/Get%20Galaxy来装的话,有很多工具是预装的,比如NGS:SAM tools,在我安装的版本下面有4个相关工具。如果没有你要的工具,可以考虑tool shed或者自己写wrapper。...

多谢啦,可不可以跟我简单说一下tool shed 和 wrapper可以在哪里找到相关的使用代码什么的?
3楼2013-06-13 12:34:42
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caskizzsqly

新虫 (正式写手)

你好,我看到你的帖子中说到Galaxy的安装,最近我也在尝试用,我是新手,参考官网上的指导也没有弄懂怎么安装,所想请教一下galaxy的安装细节,谢谢了!
5楼2014-06-22 10:42:32
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