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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 我在Linux下安装了GALAXY，但是里面的Tools需要自己装，不太会呀~~
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lp871

铁虫 (初入文坛)

[求助] 我在Linux下安装了GALAXY，但是里面的Tools需要自己装，不太会呀~~

大家好，本人菜鸟，在Linux系统下安装了GALAXY，但是装好之后里面的Tools需要自己装，比如SAMtools这些工具，我看了galaxy的官方网站，但还是不太懂，请各位大神给我指条明路啊~~~
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1楼 2013-06-12 22:26:31
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lp871: 金币+3, ★有帮助 2013-06-13 12:35:37
如果你是根据http://wiki.galaxyproject.org/Admin/Get%20Galaxy来装的话，有很多工具是预装的,比如NGS:SAM tools，在我安装的版本下面有4个相关工具。如果没有你要的工具，可以考虑tool shed或者自己写wrapper。
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2楼2013-06-13 04:22:12
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lp871

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wizardfan at 2013-06-13 04:22:12
如果你是根据http://wiki.galaxyproject.org/Admin/Get%20Galaxy来装的话，有很多工具是预装的,比如NGS:SAM tools，在我安装的版本下面有4个相关工具。如果没有你要的工具，可以考虑tool shed或者自己写wrapper。...

多谢啦，可不可以跟我简单说一下tool shed 和 wrapper可以在哪里找到相关的使用代码什么的？
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3楼2013-06-13 12:34:42
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by lp871 at 2013-06-13 12:34:42
多谢啦，可不可以跟我简单说一下tool shed 和 wrapper可以在哪里找到相关的使用代码什么的？...

如果你真的是菜鸟的话，tool shed比较适合你，http://wiki.galaxyproject.org/Tool%20Shed。如果有编程基础的话，可以考虑自己写wrapper，http://wiki.galaxyproject.org/Admin/Tools/ToolConfigSyntax
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4楼2013-06-13 17:35:14
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caskizzsqly

新虫 (正式写手)
你好，我看到你的帖子中说到Galaxy的安装，最近我也在尝试用，我是新手，参考官网上的指导也没有弄懂怎么安装，所想请教一下galaxy的安装细节，谢谢了！
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5楼2014-06-22 10:42:32
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