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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » Restrained Electrostatic Potential (RESP) method是用来做什么的？
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mengsk

金虫 (著名写手)

[求助] Restrained Electrostatic Potential (RESP) method是用来做什么的？

请问Restrained Electrostatic Potential (RESP) method是用来做什么的？看网站上说是重新拟合蛋白质残基对电荷的，我的聚合物体系需不需要用这种方法，我之前用gauss NBO算的电荷分布，不知道准不准？
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奋斗中的小木虫
1楼 2013-06-09 10:54:50
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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
mengsk: 金币+1, ★有帮助 2013-06-09 11:08:49
这个可以采用高斯计算RESP，你需要查一下相应的命令。最好不要采用NBO
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2楼2013-06-09 10:59:20
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mengsk

金虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lishijunzong at 2013-06-09 10:59:20
这个可以采用高斯计算RESP，你需要查一下相应的命令。最好不要采用NBO

我用gauss计算了，网上也有个操作流程。我想知道用这个方法得到的电荷比NBO好在哪里？
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奋斗中的小木虫
3楼2013-06-09 11:09:51
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yaozhq

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
http://q4md-forcefieldtools.org/RED/resp/  这种问题搜索一下很难么？
[1]  C.I. Bayly, P. Cieplak, W.D. Cornell & P.A. Kollman. A Well-Behaved Electrostatic Potential Based Method Using Charge Restraints For Determining Atom-Centered Charges: The RESP Model. J. Phys. Chem. 1993, 97, 10269-10280.

[2]  W.D. Cornell, P. Cieplak, C.I. Bayly & P.A. Kollman. Application of RESP charges to calculate conformational energies, hydrogen bond energies and free energies of solvation. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 9620-9631.

[3]  P. Cieplak, W.D. Cornell, C. Bayly & P.A. Kollman. Application of the multimolecule and multiconformational RESP methodology to biopolymers: Charge derivation for DNA, RNA and proteins. J. Comput. Chem. 1995, 16, 1357-1377.
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4楼2013-06-09 16:48:24
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