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cheap_81

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 如何生成p4p文件或者输入晶胞参数的格式

晶体是测试晶体的老是解析的,想学习一下。但是他发过来的文件有cif fcf hkl ins res,没有p4p文件。然后用了shelxtl软件打开hkl文件,被要求输入晶胞参数,也不知道格式是什么样。谢谢了。
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luxtal

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
cheap_81: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-05-31 08:40:29
你的问题很经典,解决方案也很多:
1. 手动输入:用文本编辑器打开****.CIF文件,并将具体的a,b,c,和alpha,beta,gamma值手动输入XPREP的界面。不是很方便。
2. 自制片p4p文件: 将具体的a,b,c,和alpha,beta,gamma值整理成如下格式并用文本编辑器(注意不是word,word是文字编辑器)存成与hkl文件同名的p4p文件:

CELL      8.6885   10.3384   14.4128  109.9590   91.5843  111.4945   1114.853
CELLSD    0.0002    0.0003    0.0004    0.0012    0.0014    0.0013     0.069

3. 貌似wingx能够提取cif文件的信息,很久没用了,不是十分确定。
What_we_observe_is_not_nature_itself,_but_nature_exposed_to_our_method_of_questioning----Werner_Karl_Heisenberg
2楼2013-05-31 00:00:43
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cheap_81

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by luxtal at 2013-05-31 00:00:43
你的问题很经典,解决方案也很多:
1. 手动输入:用文本编辑器打开****.CIF文件,并将具体的a,b,c,和alpha,beta,gamma值手动输入XPREP的界面。不是很方便。
2. 自制片p4p文件: 将具体的a,b,c,和alpha,be ...

再请教一下CELLSD里面的数据在哪里找到的?
3楼2013-05-31 00:33:06
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luxtal

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

如果a=12.1634(3), 那么cellsd就为0.0003.是统计学的标准不确定性.
What_we_observe_is_not_nature_itself,_but_nature_exposed_to_our_method_of_questioning----Werner_Karl_Heisenberg
4楼2013-05-31 03:37:35
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cheap_81

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by luxtal at 2013-05-31 03:37:35
如果a=12.1634(3), 那么cellsd就为0.0003.是统计学的标准不确定性.

如果后面没有括号,是不是就是0.0000?
比如这个_cell_volume                      1246.89(15)
cellsd是不是0.0015?
5楼2013-05-31 08:54:01
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luxtal

至尊木虫 (职业作家)

What_we_observe_is_not_nature_itself,_but_nature_exposed_to_our_method_of_questioning----Werner_Karl_Heisenberg
6楼2013-05-31 21:08:52
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guangdzhuh

金虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by luxtal at 2013-05-31 21:08:52
0.015

应该是0.15,不是0.015
7楼2013-06-01 00:40:19
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guangdzhuh

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
一般来说,可以自己从cif中提取信息,自己编写txt文档,格式如下
TITLE 130429A 29-Apr-2013,21:45:15 注:title后面是文件名和日期,此行无关紧要,可以没有。
CELL 9.64476 10.07409 12.99925 65.90690 67.40410 65.01780 1010.30 此行为晶胞参数
CELLSD 0.00081 0.00081 0.00121 0.00240 0.00260 0.00230 0.15 此行为晶胞参数的误差
SOURCE Mo 0.710747 0.709317 0.713607 此行为X射线靶的类型及X射线波长,此处为钼靶的信息,铜靶的我暂时没有。
8楼2013-06-01 00:48:54
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