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meatball1982铜虫 (小有名气)
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[求助]
tinker pdbxyz 转xyz时少原子
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大家好。我初学tinker.遇到下面的问题。 我有一个pdb文件(为了说明问题，我将各个原子(23个)的位置按照序号进行了设置)。 命名为ser_num.pdb 我用tinker中的pdbxyz 将ser_num.pdb转到xyz文件（23个位置），用的是amoebabio09.prm。没有问题。 现在，我希望将两个ser_num.pdb中的各个原子放在一个新的pdb(ser_ser_num.pdb)当中（新定义了位置和序号，共有46个原子）。并用pdbxyz转换坐标，还是amoebabio09.prm。但是这个过程中，新的xyz文件只剩下34个原子了。 我的问题是： 01.是不是我的新的pdb文件定义有问题？如果是，应该如何定义。 02.如果不是pdb定义的问题，应该如何设置，使得pdbxyz过程中，xyz文件不会少原子。 03.有没有可能是参数文件的问题。  ser_num_pdb.GIF  ser_num_xyz.GIF  ser_ser_num_pdb.GIF  ser_ser_num_xyz.GIF |
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- 附件 2 : ser_ser_num.pdb
- 附件 3 : ser_ser_num.xyz
2013-05-30 18:15:52, 1.48 K
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