24小时热门版块排行榜    

查看: 5470  |  回复: 3

霏凡羽凡

银虫 (小有名气)

[求助] 蛋白三级结构预测phyre2给的结果,没怎么看懂,求前辈么看看


毕业论文里要做一张蛋白质的三级结构,我上phyre2提交了我的氨基酸序列,然后发邮件给了我个pdb文件,还有这个,pdb文件用pymol打开说错误,这个图也不知道什么意思,求解惑啊~~~
蛋白三级结构预测phyre2给的结果,没怎么看懂,求前辈么看看
phre2.PNG
回复此楼
哇哇哇
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
霏凡羽凡(silicare代发): 金币+3 2013-05-27 10:50:58
用rasmol试试,更多的软件看这里http://www.mtholyoke.edu/~mglackin/structure.html
2楼2013-05-27 08:44:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stevenshi021

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wizardfan: 金币+2, 鼓励发帖交流 2013-05-28 07:43:38
霏凡羽凡: 金币+7, ★★★很有帮助 2013-05-28 19:37:01
这个说明你给的蛋白序列同源性较低,给出的结果都是片段而不是你蛋白的全长。可信度较低。至于你说打不开pdb文件我就不知道了,我一直可以打开的从这个网站得到的结果!多用几个网站试试,每个网站的计算方法都不一样。
祝好运。
3楼2013-05-27 11:31:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

霏凡羽凡

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by stevenshi021 at 2013-05-27 11:31:32
这个说明你给的蛋白序列同源性较低,给出的结果都是片段而不是你蛋白的全长。可信度较低。至于你说打不开pdb文件我就不知道了,我一直可以打开的从这个网站得到的结果!多用几个网站试试,每个网站的计算方法都不一 ...

最后不知道怎么打开了,但是只有3个@螺旋,其他啥都没有,第二个结构并没有,谢谢了
哇哇哇
4楼2013-05-28 19:36:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 霏凡羽凡 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 5/250 2026-08-23 04:07 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 7/350 2026-08-23 03:55 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 6/300 2026-08-23 03:40 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 QTy3jDtz1uLt 2026-08-21 9/450 2026-08-23 03:04 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 QTy3jDtz1uLt 2026-08-21 11/550 2026-08-23 02:55 by OEbVnUOu01ol
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 3/150 2026-08-23 00:55 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +11 羊腰板 2026-08-21 11/550 2026-08-22 22:03 by lsbin3733
[基金申请] 人气不行了 +8 fansofjerry 2026-08-21 8/400 2026-08-22 16:30 by zyqchem
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +10 kulium 2026-08-21 13/650 2026-08-21 21:58 by alongwaytogo
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +16 医学老男孩 2026-08-20 20/1000 2026-08-21 21:13 by Ldrop2023
[基金申请] 科研孤儿太难了 +17 我4大白菜 2026-08-20 18/900 2026-08-21 20:57 by zhangev
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 让我中一个面上吧! +11 大萍1987 2026-08-20 13/650 2026-08-21 14:48 by 20120902066
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
信息提示
请填处理意见