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加油鱼儿

铜虫 (小有名气)

[求助] 如何知道分子尺寸大小的?????????急求!

我想知道乙二醇、对苯二甲酸的分子尺寸大小,可自己不知道如何着手,希望高人指点下!谢谢。。。
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
加油鱼儿: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-05-23 15:18:14
ben_ladeng: 金币+2, 谢谢解答 2013-05-24 22:24:09
你有这两个分子的坐标文件吗?

把他们分别导入到VMD

输入命令:

set sel [atomselect top all]
set minmax [measure minmax $sel]

这样就可以输出分子在xyz三个方向的最大最小值,如此可以粗略的估算分子尺寸大小

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2013-05-23 14:00:28
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加油鱼儿

铜虫 (小有名气)

送红花一朵
内容已删除
努力了就会有收获
3楼2013-05-23 15:12:09
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broken1999

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+3, 鼓励交流 2013-05-25 18:34:11
加油鱼儿: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢!我懂了。。。 2013-05-26 10:19:54
单位埃
最大和最小的原子的坐标

对苯二甲酸
{-2.865999937057495 -1.5529999732971191 0.7490000128746033}
{4.813000202178955 3.121999979019165 1.7610000371932983}

乙二醇
{-1.871000051498413 0.9869999885559082 -1.284000039100647}
{1.5269999504089355 4.557000160217285 1.284000039100647}
4楼2013-05-25 15:23:21
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