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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » DS中prepare protein失败
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xueer小雯

金虫 (初入文坛)

[求助] DS中prepare protein失败

prapare protein我用的是默认的参数 但是这个蛋白总是在step4与step5发生error

log里面写到

[2013-05-23 09:48:08] [ERROR] Atom 79:ARG:4:HH11-402.21300-928.96700 not found in the molecule while updating coordinate

大概有好几百个原子是这样的找不到坐标

求问这种问题怎么办？
我是从pdb库中新下载的蛋白我自己没有动过
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1楼 2013-05-23 10:14:44
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Nelly3816

新虫 (小有名气)
请问你现在还有在做DS吗？我的在第一步就出错了，我已经加过力场和去除过其他的小分子的

发自小木虫Android客户端
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2楼2020-03-20 16:55:25
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