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anmin0127

至尊木虫 (知名作家)

[求助] Gaussian混合基组求助

各位大牛,小弟现在做有机物与金属离子的配合物稳定性研究,在做单独的有机物的结构优化、分子能量或者其他计算的时候选的是6-311++G**基组,金属离子选用的是是LANL2DZ基组。
    然后我将金属离子与有机物进行配合物研究(结构优化、能量等),进行配合后的计算是不是应该选择将上面两个基组都包括的混合基组呢?
    我用的是windows系统下的高斯09软件,请问在这个条件下如何实现混合基组的使用?谢谢!!!
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kaegi

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by anmin0127 at 2013-05-21 20:12:49
这个分子坐标应该是经过一次结构优化后得到的数据吧?...

看你的需要,贴入未优化的分子坐标,用混合基组开始优化也可以
6楼2013-05-23 09:02:16
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普通回帖

kaegi

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
anmin0127: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 谢谢啊 2013-05-21 19:20:40
输入文件的具体格式可以参考如下:
%mem=6GB
%nprocshared=8
#p wb97xd/genecp opt freq integral=ultrafine

wqfw

0 1
分子坐标

-C -H -O -N -B -F -Na -Si -P -S -Cl  
6-31+G(d)
****
-Pd
lanl2dz
****

-Pd
lanl2dz


对于混合基组注意的就是头文件基组部分写genecp,尾文件部分参考上面的格式,替换成你的基组以及对应元素就可以了。
2楼2013-05-21 16:58:43
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anmin0127

至尊木虫 (知名作家)

引用回帖:
2楼: Originally posted by kaegi at 2013-05-21 16:58:43
输入文件的具体格式可以参考如下:
%mem=6GB
%nprocshared=8
#p wb97xd/genecp opt freq integral=ultrafine

wqfw

0 1
分子坐标

-C -H -O -N -B -F -Na -Si -P -S -Cl  
6-31+G(d)
****
-Pd
lanl ...

这个分子坐标应该是经过一次结构优化后得到的数据吧?
3楼2013-05-21 20:12:49
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dai_shen844

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
anmin0127: 金币+3, ★★★很有帮助 2013-05-22 17:06:39
引用回帖:
3楼: Originally posted by anmin0127 at 2013-05-21 20:12:49
这个分子坐标应该是经过一次结构优化后得到的数据吧?...

关键词里面已经有了opt了,不用再优化`~希望对你有帮助~
潜心
4楼2013-05-22 16:35:16
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anmin0127

至尊木虫 (知名作家)

引用回帖:
4楼: Originally posted by dai_shen844 at 2013-05-22 16:35:16
关键词里面已经有了opt了,不用再优化`~希望对你有帮助~...

我在做金属配合物研究的时候金属和有机物用的是不同的基组,在做配合物研究的时需要自己写程序运用混合基组

但是在分别进行金属离子和有机物研究时直接用Gview导入计算,使用软件选择基组就行吧?
5楼2013-05-22 17:06:58
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anmin0127

至尊木虫 (知名作家)

引用回帖:
6楼: Originally posted by kaegi at 2013-05-23 09:02:16
看你的需要,贴入未优化的分子坐标,用混合基组开始优化也可以...

嗯,画出结构,然后用TXT打开输入文件,在输入文件中分子坐标后面进行基组设置就行啊?
7楼2013-05-24 08:35:32
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kaegi

金虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by anmin0127 at 2013-05-24 08:35:32
嗯,画出结构,然后用TXT打开输入文件,在输入文件中分子坐标后面进行基组设置就行啊?...

恩,除了修改坐标后面基组,也注意头文件命令行里面基组参数为genecp
8楼2013-05-24 08:39:27
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anmin0127

至尊木虫 (知名作家)

引用回帖:
8楼: Originally posted by kaegi at 2013-05-24 08:39:27
恩,除了修改坐标后面基组,也注意头文件命令行里面基组参数为genecp...

嗯,好的,我试试,这样操作的话对于不使用混合基组的时候的计算也是适用的啊?
9楼2013-05-24 08:44:23
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anmin0127

至尊木虫 (知名作家)

引用回帖:
9楼: Originally posted by anmin0127 at 2013-05-24 08:44:23
嗯,好的,我试试,这样操作的话对于不使用混合基组的时候的计算也是适用的啊?...

我在混合基组使用里面要用赝势,是不是应该写成
b3lyp/ gen pseudo=read

还是说写成genecp,谢谢
10楼2013-05-24 09:25:34
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