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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 如何在gaussian09中应用MC3BB泛函，应如何设置参数呢？
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泊轩涯

金虫 (正式写手)

[求助] 如何在gaussian09中应用MC3BB泛函，应如何设置参数呢？

各位大牛：两个问题，
    第一个如题！
    第二个如下：在文献中经常看到利用基组6-311++(3df,2df,2p)，可是我用GV构建输入文件，在gaussian 计算设置里面，只有两个可选，如图。最后只能选择6-311++(3df,2p)，而人为地编辑输入文件使之为6-311++(3df,2df,2p)，就会报错！请问是怎么回事？
    谢谢各位能在百忙之中回答小弟的问题！

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1楼 2012-09-26 21:36:19
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回帖置顶 ( 共有2个 )

yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

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【答案】应助回帖

yjcmwgk: 回帖置顶 2012-10-11 12:47:20
引用回帖:
5楼: Originally posted by 泊轩涯 at 2012-10-11 08:42:15
J. Phys. Chem. A2004, 108, 2715-2719；这里有提到那个基组；还有，刚才的泛函用gaussian09设置iop就可以用，但是我不知道怎样设置？...

6-311++G(3d2f,2df,2p)这个基组是个混合基组
对重原子的处理被区分开来：对于第二周期原子采用6-311+G(2df)；对更重的原子采用6-311+G(3d2f)
至于泛函，我要先研读下文献里给出的泛函的各项的形式及系数，这样才好给出iop设置啊。请稍事等待
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6楼2012-10-11 09:20:40
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
yjcmwgk: 回帖置顶 2012-10-11 12:47:18
泊轩涯: 金币+30, ★★★★★最佳答案 2012-10-11 21:40:36
zhou2009: 金币+10, QC强帖+1 2012-10-12 14:52:58
好吧，继续，关于你所提到的MC3BB，首先声明，它不是泛函，而且他也不是用来做优化的，就是来算能量的。它是复合能量计算，可以说是在DFT框架内构建一个与Gn和GnMP2的理念相似的能量计算体系。所以，不要指望Gaussian通过简单地iop就能设置MC3BB。

我发现Gaussian确实可以计算MC3BB。按照J. Phys. Chem. A, 108, 4786给出的能量计算公式，设想步骤如下：

1用HF/6-31+G(d,p)计算体系能量E(HF/DIDZ)。至于DIDZ这个名字，是DG Truhlar等规定的，等价于高斯中的6-31+G(d,p)
2用MP2/6-31+G(d,p)计算体系能量E(MP2/DIDZ)
3做个简单的减法DeltaE(MP2|HF/DIDZ)=E(MP2/DIDZ)-E(HF/DIDZ)。这个值先放着。
4用BBX/MG3S计算体系能量E(BBX/MG3S)。当然这样直接输入泛函和基组，高斯不认识。BBX泛函就是把BB1K泛函的HF成分从42%调整到39%，当然高斯中也没有BB1K（大家不能指望高斯里什么都有，毕竟全世界每年都会生产几十上百种泛函，所以应该学会自己对照泛函形式设置iop(3/76), iop(3/77), iop(3/78)）。对于这个所谓的BBX，我们应该输入BB95 iop(3/76=0610003900)。对于这个所谓的MG3S基组，其实就是MG3基组对H取消了弥散函数。而MG3基组就是把6-311++G(3d2f, 2df, 2p)直接用在H-Si这些原子上，并且对更重的原子的基函数进行了改进。对于所谓的6-311++G(3d2f, 2df, 2p)基组，我在上一个回帖中进行了解释。MG3基组可以在这里下载(http://comp.chem.umn.edu/basissets/basis.cgi)，下载完毕后删除H的弥散函数就是MG3S了。在高斯中用自定义基组，这个不用我教吧。
5得到E(BBX/MG3S)后，按照E(MC3BB)=b[E(HF/DIDZ)+aDeltaE(MP2|HF/DIDZ)]+(1-b)E(BBX/MG3S)计算得到最终结果。其中a=1.332, b=0.205

最后，楼主一定要注意：千万不要拘泥于这一篇特定文献的方法和基组，灵活运用方为上策。

又及：我觉得我应该感谢楼主。谢谢楼主提供的文献。我一直不明白6-311++G(3d2f,2df,2p)是什么基组，这次明白了。另外，这是我第一次接触所谓的MCDFT，上面的步骤，也是我读完楼主提供的文献后想出的，如果有误，敬请高手指正

[ Last edited by yjcmwgk on 2012-10-11 at 10:50 ]
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7楼2012-10-11 10:42:29
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

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【答案】应助回帖

关于这个奇怪的基组 你给我一个文献例子吧 给出它的杂志名 卷期号 页码
这种写法我确实没在文献中见过 但是我屡次听到别人提起
当我要求有人给出文献的“杂志名 卷期号 页码”的时候 从未有人给出过

[ Last edited by yjcmwgk on 2012-10-10 at 09:37 ]
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2楼2012-10-10 09:24:38
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

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【答案】应助回帖

MC3BB在MLGauss程序中有
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3楼2012-10-10 09:36:13
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泊轩涯

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yjcmwgk at 2012-10-10 09:24:38
关于这个奇怪的基组 你给我一个文献例子吧 给出它的杂志名 卷期号 页码
这种写法我确实没在文献中见过 但是我屡次听到别人提起
当我要求有人给出文献的“杂志名 卷期号 页码”的时候 从未有人给出过
...

谢谢区长的关注！ 首先提出这个泛函的文献是J. Phys. Chem. A2004, 108, 4786-4791；应用这个泛函的文献之一是J. Phys. Chem. A2005, 109, 773-778；
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4楼2012-10-11 08:32:57
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泊轩涯

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yjcmwgk at 2012-10-10 09:24:38
关于这个奇怪的基组 你给我一个文献例子吧 给出它的杂志名 卷期号 页码
这种写法我确实没在文献中见过 但是我屡次听到别人提起
当我要求有人给出文献的“杂志名 卷期号 页码”的时候 从未有人给出过
...

J. Phys. Chem. A2004, 108, 2715-2719；这里有提到那个基组；还有，刚才的泛函用gaussian09设置iop就可以用，但是我不知道怎样设置？
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5楼2012-10-11 08:42:15
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泊轩涯

金虫 (正式写手)
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7楼: Originally posted by yjcmwgk at 2012-10-11 10:42:29
好吧，继续，关于你所提到的MC3BB，首先声明，它不是泛函，而且他也不是用来做优化的，就是来算能量的。它是复合能量计算，可以说是在DFT框架内构建一个与Gn和GnMP2的理念相似的能量计算体系。所以，不要指望Gaussi ...

区长的悉心指导确实让人感动！我刚接触gaussian两个月，身边也没有可以指导的人，谢谢区长了！
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8楼2012-10-11 21:43:59
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yjcmwgk

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8楼: Originally posted by 泊轩涯 at 2012-10-11 21:43:59
区长的悉心指导确实让人感动！我刚接触gaussian两个月，身边也没有可以指导的人，谢谢区长了！...

其实 我很想知道件事儿啊 很多人都说“身边也没有可以指导的人”
问题是 我接触的院校里 都有理论与计算化学这个方面呀
你们学校或研究所没有么？

我确实不知道是为什么
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9楼2012-10-12 14:39:21
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泊轩涯

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9楼: Originally posted by yjcmwgk at 2012-10-12 14:39:21
其实 我很想知道件事儿啊 很多人都说“身边也没有可以指导的人”
问题是 我接触的院校里 都有理论与计算化学这个方面呀
你们学校或研究所没有么？

我确实不知道是为什么...

多谢区长的提醒！我会去相关学院的的这个课题组去请教，之前一直局限在自己的学院里！
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10楼2012-10-14 10:18:24
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