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hou9811

铜虫 (小有名气)

应助: 3 (幼儿园)
金币: 205.6
帖子: 132
在线: 47.7小时
虫号: 2397546
注册: 2013-04-03
性别: GG
专业: 高分子合成化学

[求助] 优化表面不成功，瞅瞅什么毛病

我想做TATB超晶胞的粘结剂优化，首先是建立超晶胞，遇到些麻烦，就是建立好（0 0 1)切割面后，用discover优化出现了问题，求大神解释。还有就是怎么把建好的粘结剂放入超晶胞内，是不是建一个和超晶胞一样大小的空晶胞再将分子链放进去，问题是分子链放进去之后能不能旋转，我只能上下移动不能翻转啊大哥们帮帮我吧。老师发话了做不出来不给毕业

我想试着做出来你们一定要帮帮我啊附上我用的文件
#BIOSYM btcl 3
#
#  Input File For Discover Generated By Materials Studio
#  Input Client Model Document: D:\Untitled Files\Documents\TATNBZ.TATB (0 0 1).xsd
#  Job: [6FVNE] - TATNBZ.TATB (0 0 1) Disco Min
#
  autoEcho off
#
# Begin Forcefield Section
  begin forcefield = compass
#
# Nonbond section:
  forcefield nonbond \
   +separate_coulomb \
vdw \
summation_method = atom_based \
   cutoff = 9.50 \
   spline_width = 1.00 \
   buffer_width = 0.50 \
coulomb \
summation_method = ewald \
   ewald_accuracy = 1.e-002 \
   update_width = 1.00 \
dielectric_value = 1.0000
#
# vdW long range energy correction
  vdWTailCorrection 9.50
#
# Fix constrained Atom subset
  setAtomMovability  fixed  2__fix \
"MDF_FIXED_ATOMS_SUBSET"
# End Forcefield Section
#
# Minimization Section:
  minimize \
method = newton \
iteration_limit = 5000 \
      sd \
         convergence = 1000.0000000 \
         line_search_precision = 0.5000000 \
      cg \
         convergence = 10.0000000 \
         line_search_precision = 0.5000000 \
         method = fletcher \
      newton \
         convergence = 0.1000000 \
         line_search_precision = 0.5000000 \
         max_atoms = 200 \
         method = bfgs
#
# Write coordinate file:
  writeFile coordinate filename = .cor

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