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yyosaka08

金虫 (正式写手)

[求助] 结构精修

急!已经投稿,结构需要进一步精修。请高手们帮忙看看。第一个结构上的硝酸根在对称轴上,占有率为0.5,使得整个结构电荷不平衡;第二个游离水无序了需要加氢(无序水个数也有可能有问题),用Cc才能解出来,不知道手性在哪里?第三个结构中的两个游离的酸根共用一个H是否正确?请大侠们帮忙精修精修。金币不够可以再给!先谢谢了!
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superliky

木虫 (正式写手)

希望有高手帮到你。也希望你的研究不是灌水文章。
2楼2013-05-14 22:54:11
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superliky

木虫 (正式写手)


updayday: 金币+1, 感谢您的热心参与 2013-05-15 21:15:35
粗略看了你的三个数据中的res文件,你的晶体质量还是挺好的。估计论坛上很多人都有能力帮到你。
我很久没有解晶体了,64位电脑上也没有解晶体的软件。暂时还是帮不了你。
你的赏金这么高,估计,过两天,你的问题就能解决。
3楼2013-05-15 02:11:37
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superliky

木虫 (正式写手)

粗略看了一下。你这三个数据的结构都很相近。
第一个结构,应该很容易解决。
第二个,如果水分子对你的组装影响不大,可以squeeze掉
第三个,就是羧酸加氢,很容易解决。

就研究本身来说,你这几个结构,就是灌水的,希望你能交个好运。
4楼2013-05-15 02:20:16
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xiaochong98

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
yyosaka08: 金币+10, 有帮助 2013-05-15 09:00:08
你的第一个结构没有问题,不用继续精修,因为你的空间群是P-1,而硝酸根的N7原子正好处于特殊位置(0.500000   0.000000   0.000000),故其占有率为10.5,其实由于对称变换其代表的是一个N原子,这个在文章中解释一下即可。不存在电荷不平衡问题。
北京人
5楼2013-05-15 08:16:55
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yyosaka08

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by xiaochong98 at 2013-05-15 08:16:55
你的第一个结构没有问题,不用继续精修,因为你的空间群是P-1,而硝酸根的N7原子正好处于特殊位置(0.500000   0.000000   0.000000),故其占有率为10.5,其实由于对称变换其代表的是一个N原子,这个在文章中解释一 ...

我是觉得硝酸根在特殊的位置应该没有问题,只是被人家说了电荷不平衡。嗯,谢谢你。
6楼2013-05-15 08:59:32
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yyosaka08

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by superliky at 2013-05-15 02:20:16
粗略看了一下。你这三个数据的结构都很相近。
第一个结构,应该很容易解决。
第二个,如果水分子对你的组装影响不大,可以squeeze掉
第三个,就是羧酸加氢,很容易解决。

就研究本身来说,你这几个结构,就是 ...

谢谢您!第一个我不确定,本来我也觉得没有问题,因为在对称轴上。第三个中的两个O原子的距离只有0.24几nm,所以我认为它们都是半质子化状态,共有一个H,也是想问问这样到底正确不?第二个的话,我试试看看squeeze。这几个结构是很简单,但是也确实还没有完全一样的结构报道。谢谢您的建议!希望以后会出一下比较好的结构。多向您学习!
7楼2013-05-15 09:11:09
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
第一个中既然硝酸根的N为0.5,其对应的O也应该是0.5。这样通过对称操作得到的是一个完整的硝酸根,而且R值也会有较大的下降。
8楼2013-05-15 14:15:17
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

对于1电荷平衡问题,先考虑一下反应是否在弱酸性条件下完成的,如果是,两个游离的含羧基配体应该加H。
9楼2013-05-15 14:22:31
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10楼2013-05-15 14:38:41
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