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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » 结构精修
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yyosaka08

金虫 (正式写手)

[求助] 结构精修

急！已经投稿，结构需要进一步精修。请高手们帮忙看看。第一个结构上的硝酸根在对称轴上，占有率为0.5，使得整个结构电荷不平衡；第二个游离水无序了需要加氢（无序水个数也有可能有问题），用Cc才能解出来，不知道手性在哪里？第三个结构中的两个游离的酸根共用一个H是否正确？请大侠们帮忙精修精修。金币不够可以再给！先谢谢了！
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1楼 2013-05-14 22:15:29
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superliky

木虫 (正式写手)
希望有高手帮到你。也希望你的研究不是灌水文章。
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2楼2013-05-14 22:54:11
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superliky

木虫 (正式写手)
★
updayday: 金币+1, 感谢您的热心参与 2013-05-15 21:15:35
粗略看了你的三个数据中的res文件，你的晶体质量还是挺好的。估计论坛上很多人都有能力帮到你。
我很久没有解晶体了，64位电脑上也没有解晶体的软件。暂时还是帮不了你。
你的赏金这么高，估计，过两天，你的问题就能解决。
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3楼2013-05-15 02:11:37
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superliky

木虫 (正式写手)
粗略看了一下。你这三个数据的结构都很相近。
第一个结构，应该很容易解决。
第二个，如果水分子对你的组装影响不大，可以squeeze掉
第三个，就是羧酸加氢，很容易解决。

就研究本身来说，你这几个结构，就是灌水的，希望你能交个好运。
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4楼2013-05-15 02:20:16
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xiaochong98

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
yyosaka08: 金币+10, ★有帮助 2013-05-15 09:00:08
你的第一个结构没有问题，不用继续精修，因为你的空间群是P-1，而硝酸根的N7原子正好处于特殊位置（0.500000   0.000000   0.000000），故其占有率为10.5，其实由于对称变换其代表的是一个N原子，这个在文章中解释一下即可。不存在电荷不平衡问题。
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北京人
5楼2013-05-15 08:16:55
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yyosaka08

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by xiaochong98 at 2013-05-15 08:16:55
你的第一个结构没有问题，不用继续精修，因为你的空间群是P-1，而硝酸根的N7原子正好处于特殊位置（0.500000   0.000000   0.000000），故其占有率为10.5，其实由于对称变换其代表的是一个N原子，这个在文章中解释一 ...

我是觉得硝酸根在特殊的位置应该没有问题，只是被人家说了电荷不平衡。嗯，谢谢你。
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6楼2013-05-15 08:59:32
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yyosaka08

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by superliky at 2013-05-15 02:20:16
粗略看了一下。你这三个数据的结构都很相近。
第一个结构，应该很容易解决。
第二个，如果水分子对你的组装影响不大，可以squeeze掉
第三个，就是羧酸加氢，很容易解决。

就研究本身来说，你这几个结构，就是 ...

谢谢您！第一个我不确定，本来我也觉得没有问题，因为在对称轴上。第三个中的两个O原子的距离只有0.24几nm，所以我认为它们都是半质子化状态，共有一个H，也是想问问这样到底正确不？第二个的话，我试试看看squeeze。这几个结构是很简单，但是也确实还没有完全一样的结构报道。谢谢您的建议！希望以后会出一下比较好的结构。多向您学习！
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7楼2013-05-15 09:11:09
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
第一个中既然硝酸根的N为0.5，其对应的O也应该是0.5。这样通过对称操作得到的是一个完整的硝酸根，而且R值也会有较大的下降。
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8楼2013-05-15 14:15:17
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

对于1电荷平衡问题，先考虑一下反应是否在弱酸性条件下完成的，如果是，两个游离的含羧基配体应该加H。
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9楼2013-05-15 14:22:31
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jason8787
10楼2013-05-15 14:38:41
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