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philip890220铜虫 (初入文坛)
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[求助]
perl程序求助,请高手不吝赐教~~
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要处理的文件格式是这样的（具体文件见附件）： DR1573 DR1284 DR0420 DR2025 DRA0288 DR1858 DR2541 DR2083 DRA0118 DR0920 DR1667 DR1326 DR2308 DR1058 DR2363 DRA0071 每一行两个基因，同一行中，左边的基因称为右边的父节点，右边的基因是左边的子节点，就拿第一行左边这个基因DR1573来说，DR1284就是他的子节点，DR1573是DR1284的父节点。 我现在想做的事情是这样的： 还拿DR1573这个基因举例，我需要找出来他的所有的父节点A(为了便于说明就姑且称之为A，当然A可能不止一个，下同)与子节点B，A也有自己的父子节点C和D，B也有自己的父子节点E、F，分别把CDEF求出来，CDEF可能也有自己的父子节点，再求出来，总之只要是相关的全部求出来，有点类似于株连九族的赶脚，呵呵~~，就是这么一个程序把我难住了，求高手赐教~~~~ 要是哪里没说清楚亲们就直接问就好了~~，先谢谢了~~~ PS：附件是需要处理的文件~~~[ Last edited by philip890220 on 2013-5-14 at 00:56 ] |
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2013-05-14 00:54:26, 32.47 K
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
philip890220: 金币+1, 谢谢回复，但是我没学过pytho~~~~呵呵~~ 2013-05-14 08:39:16
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philip890220: 金币+1, 谢谢回复，但是我没学过pytho~~~~呵呵~~ 2013-05-14 08:39:16
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不懂perl,但是用python的dict可以这么解决 弄一个dict,数据是 key-value pair key是字符串,基因名字 value是一个list,子基因列表 这样只要有一个基因,可以直接得到子基因,然后一路递归下去,直到没有子基因为止. 如果想要双向的(从子基因到父基因),有2个办法: 1.再多做一个dict,键值是基因名字,value是父基因列表 2.还是原来那个dict,key不变,value变成2个元素的list,list[0]是父基因列表,list[1]是子基因列表 |
2楼2013-05-14 03:56:07
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jjdg: 金币+1, 感谢参与 2013-05-21 11:40:32
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3楼2013-05-21 09:54:07
philip890220
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4楼2013-05-21 19:25:21
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5楼2013-05-21 22:57:31
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philip890220
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