| 查看: 1236 | 回复: 12 | ||
philip890220铜虫 (初入文坛)
|
[求助]
perl程序求助,请高手不吝赐教~~
|
|
要处理的文件格式是这样的（具体文件见附件）： DR1573 DR1284 DR0420 DR2025 DRA0288 DR1858 DR2541 DR2083 DRA0118 DR0920 DR1667 DR1326 DR2308 DR1058 DR2363 DRA0071 每一行两个基因，同一行中，左边的基因称为右边的父节点，右边的基因是左边的子节点，就拿第一行左边这个基因DR1573来说，DR1284就是他的子节点，DR1573是DR1284的父节点。 我现在想做的事情是这样的： 还拿DR1573这个基因举例，我需要找出来他的所有的父节点A(为了便于说明就姑且称之为A，当然A可能不止一个，下同)与子节点B，A也有自己的父子节点C和D，B也有自己的父子节点E、F，分别把CDEF求出来，CDEF可能也有自己的父子节点，再求出来，总之只要是相关的全部求出来，有点类似于株连九族的赶脚，呵呵~~，就是这么一个程序把我难住了，求高手赐教~~~~ 要是哪里没说清楚亲们就直接问就好了~~，先谢谢了~~~ PS：附件是需要处理的文件~~~[ Last edited by philip890220 on 2013-5-14 at 00:56 ] |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : pair_gene_0.90.txt
2013-05-14 00:54:26, 32.47 K
» 猜你喜欢
327求调剂
已经有28人回复
-
一志愿中科大材料与化工，353分还有调剂学校吗
已经有6人回复
-
0854求调剂
已经有17人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
药学求调剂
已经有15人回复
-
初试324 中药学 一志愿天中医 求调剂
已经有4人回复
-
279学硕食品专业求调剂院校
已经有29人回复
-
294求调剂
已经有10人回复
-
恳请有学校收留
已经有6人回复
-
求调剂推荐
已经有8人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- perl程序求助，请大神们赐教~~~
已经有9人回复
- 内部带花的玻璃球是怎么生产的？请各位高手不吝赐教。谢了！
已经有18人回复
- 移动硬盘分区后的整合问题 望高手不吝赐教
已经有19人回复
- [color=Red]想投国外的工程类SCI期刊，要如何投递，请指教[/color]
已经有5人回复
- 这样的图怎么在word中怎么搞？望高手不吝赐教，，万分感谢！！
已经有4人回复
libralibra
至尊木虫 (著名写手)
骠骑将军
- 程序强帖: 40
- 应助: 817 (博后)
- 金币: 12914.1
- 红花: 64
- 帖子: 2238
- 在线: 287.3小时
- 虫号: 696514
- 注册: 2009-02-05
- 专业: 计算机软件
【答案】应助回帖
★
感谢参与，应助指数 +1
philip890220: 金币+1, 谢谢回复，但是我没学过pytho~~~~呵呵~~ 2013-05-14 08:39:16
感谢参与，应助指数 +1
philip890220: 金币+1, 谢谢回复，但是我没学过pytho~~~~呵呵~~ 2013-05-14 08:39:16
|
不懂perl,但是用python的dict可以这么解决 弄一个dict,数据是 key-value pair key是字符串,基因名字 value是一个list,子基因列表 这样只要有一个基因,可以直接得到子基因,然后一路递归下去,直到没有子基因为止. 如果想要双向的(从子基因到父基因),有2个办法: 1.再多做一个dict,键值是基因名字,value是父基因列表 2.还是原来那个dict,key不变,value变成2个元素的list,list[0]是父基因列表,list[1]是子基因列表 |
2楼2013-05-14 03:56:07
★
jjdg: 金币+1, 感谢参与 2013-05-21 11:40:32
jjdg: 金币+1, 感谢参与 2013-05-21 11:40:32
|
本帖内容被屏蔽 |
3楼2013-05-21 09:54:07
philip890220
铜虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 391
- 散金: 10
- 帖子: 34
- 在线: 15.1小时
- 虫号: 1849105
- 注册: 2012-06-06
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
4楼2013-05-21 19:25:21
|
本帖内容被屏蔽 |
5楼2013-05-21 22:57:31
6楼2013-05-22 09:29:19
7楼2013-05-22 09:59:56
philip890220
铜虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 391
- 散金: 10
- 帖子: 34
- 在线: 15.1小时
- 虫号: 1849105
- 注册: 2012-06-06
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
8楼2013-05-22 14:22:49
philip890220
铜虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 391
- 散金: 10
- 帖子: 34
- 在线: 15.1小时
- 虫号: 1849105
- 注册: 2012-06-06
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
9楼2013-05-22 14:23:51
10楼2013-06-07 11:23:59
20
