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晴空will

新虫 (初入文坛)

[求助] 基因甲基化

亲们呀,刚开始接触甲基化,完全无从下手呀,有没有好的建议呀?最好能分享一下学习经验,能有材料资源就更好了!新手呀,还不太会玩,见谅呀!谢谢啦!
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
kx444555: 金币+5, 鼓励交流 2013-06-17 23:10:33
1949stone: MolEPI+1, good 2013-06-18 08:52:58
DNA甲基化的高通量测序的基本方法可以分为两大类:
1.非质谱方法:比如重亚硫酸盐测序方法检测DNAde甲基化;甲基化-敏感性单链构想分析;DNA的甲基化改变的变性梯度胶电泳;DNA的甲基化特异性寡核苷酸生物芯片分析,生物芯片分析也能够用于DNA测序等等。
2.质谱方法:测定DNA甲基化修饰之后的相对分子量变化,MS-MS既可以用测定多肽序列,也可以用于测定寡核苷酸序列,可以在测定甲基化特异性寡核苷酸序列前用限制性内切酶切开DNA,不含有修饰的DNA部分可直接用酶法和化学法测定,剩下的有修饰的部分DNA片段用MS-MS。

参考文献:
1.MMB 507-DNA methylation,which is one of Methods in Molecular Biology Series.http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6015850

2.John N. Abelson Melvin I. Simon ect .,Method in Enzymology Vol-402,Biological Mass Spectrometry,Elsevier Inc,2005.
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=5795342
DNA甲基化的测序的研究是现在研究的热点表观遗传学研究中的DNA甲基化的结构和功能影响的第一步,或者说起点,没有这一步,DNA甲基化(本身就是生命科学的研究最前沿之一)的生物效应只是空中楼阁。DNA甲基化不被认为是DNA的碱基序列发生了改变,即遗传物质未变生物体的表达性状却改变了。
高通量DNA的甲基化测序研究本身也是高通量DNA测序的一个重大进展。DNA的核苷和碱基的修饰种类很多,这些修饰成分都不能用常规的酶法和化学法测定。
最好的高通量DNA的修饰成分的测序是质谱方法:测定DNA甲基化修饰之后的相对分子量变化,MS-MS既可以用测定多肽序列,也可以用于测定寡核苷酸序列,可以在测定甲基化特异性寡核苷酸序列前用限制性内切酶切开DNA,不含有修饰的DNA部分可直接用酶法和化学法测定,剩下的有修饰的部分DNA片段用MS-MS。目前是需要很大的发展。
还有一本中文翻译的MMB系列的表观遗传学实验手册。
Trygve O.Tollefsbol 著,吴超群 等译,表观遗传学实验手册,上海科技出版社,2007。
你可以看一下,我这里没有该书电子版。

用我答过的帖子的内容回答一下。具体问题可以在讨论。
4楼2013-06-17 22:03:09
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xiong-y-x

金虫 (正式写手)

偶也是要做甲基化检测 我也不懂呢 同求
2楼2013-05-20 16:23:17
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班委

新虫 (初入文坛)

偶是刚接触到甲基化的知识,楼主有啥好资料能不能跟俺说说
3楼2013-06-17 18:54:44
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

5楼2013-06-17 23:14:48
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

★ ★ ★ ★ ★
1949stone: MolEPI+1, 非常好的分享 2013-06-18 08:53:25
1949stone: 金币+5, MolEPI-1, 不好意思 加错了 我想给你金币的 2013-06-18 08:53:57
Methylation: From DNA, RNA and Histones to Diseases and Treatment(2012)

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=5253413

书不错!参考一下吧。DNA甲基化目前还非常前沿的研究领域。
6楼2013-06-18 02:08:55
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