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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 求解：高斯计算芳胺不共平面
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xpyp

木虫 (小有名气)

[求助] 求解：高斯计算芳胺不共平面

采用b3lyp/6-31g**优化芳胺结构，发现NH2(兰色标记的)和芳环不在同一平面上,为什么?

芳胺.jpg
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1楼 2013-05-12 01:34:05
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dai_shen844

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
NH3就不在一个平面上啊，N的三键是个锥形。。。
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潜心
2楼2013-05-12 11:18:17
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dai_shen844

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
xpyp: 金币+5 2013-05-12 21:09:39
推荐一个初始结构
%chk=C:\Users\Administrator\Desktop\fangan.chk
# hf/3-21g geom=connectivity

Title Card Required

0 2
C              
C                  1            B1
C                  2            B2    1            A1
C                  3            B3    2            A2    1            D1    0
C                  4            B4    3            A3    2            D2    0
H                  2            B5    1            A4    5            D3    0
H                  4            B6    3            A5    2            D4    0
H                  1            B7    2            A6    3            D5    0
F                  1            B8    2            A7    3            D6    0
N                  1            B9    2            A8    3            D7    0
N                  5           B10    4            A9    3            D8    0
H                 11           B11    5           A10    4            D9    0
H                 11           B12    5           A11    4           D10    0
C                  3           B13    2           A12    1           D11    0
H                 14           B14    3           A13    2           D12    0
H                 14           B15    3           A14    2           D13    0
N                 14           B16    3           A15    2           D14    0
H                 17           B17   14           A16    3           D15    0
H                 17           B18   14           A17    3           D16    0

   B1             1.39516000
   B2             1.39471206
   B3             1.39542701
   B4             1.39482508
   B5             1.09965530
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   B8             1.35000000
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   B12            1.00000000
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   B15            1.11714029
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   A1           120.00863221
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   A17          109.47120255
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   D15          119.99156800
   D16         -120.00841721

希望对你有帮助！~
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潜心
3楼2013-05-12 11:23:02
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xpyp

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by dai_shen844 at 2013-05-12 11:18:17
NH3就不在一个平面上啊，N的三键是个锥形。。。

据有机化学，苄基位的NH2为sp3杂化，是锥形。
但芳环上的NH2采用的是sp2杂化，应和芳环形成大∏键，
按理应在同一平面上啊。求解!
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4楼2013-05-12 14:54:49
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xpyp

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by dai_shen844 at 2013-05-12 11:23:02
推荐一个初始结构
%chk=C:\Users\Administrator\Desktop\fangan.chk
# hf/3-21g geom=connectivity

Title Card Required

0 2
C              
C                  1            B1
C                 ...

该分子貌似应带+1电荷。　那电荷和自旋多重度是否应为：1 1　（而非0 2) ???
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5楼2013-05-12 16:04:50
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dreamyeye

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xpyp: 金币+5, ★有帮助 2013-05-12 21:08:41
引用回帖:
4楼: Originally posted by xpyp at 2013-05-12 14:54:49
据有机化学，苄基位的NH2为sp3杂化，是锥形。
但芳环上的NH2采用的是sp2杂化，应和芳环形成大∏键，
按理应在同一平面上啊。求解!...

应该是介于sp2和sp3杂化之间，近似与sp2，但不完全是，也就是不完全共平面。
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6楼2013-05-12 18:19:16
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t13340033021

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
记得有篇文献说用dft过大的基组优化芳环会引起一个错误的
LZ上ACS???下  貌似很有???的一篇
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甲烷无敌
7楼2013-05-12 20:50:08
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t13340033021

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
xpyp: 金币+10, ★★★很有帮助 2013-05-12 21:08:26
记得有篇文献说用dft过大的基组优化芳环会引起一个错误的
LZ上ACS搜下  貌似很有名的一篇
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甲烷无敌
8楼2013-05-12 20:50:14
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xpyp

木虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by t13340033021 at 2013-05-12 20:50:14
记得有篇文献说用dft过大的基组优化芳环会引起一个错误的
LZ上ACS搜下  貌似很有名的一篇

我用过hf/6-31g优化为共平面；
用b3lyp/6-31g优化就不在共平面了。能帮找找是哪篇文献吗？
我这几天上不了学校的网，进不了ACS.
   谢谢！
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9楼2013-05-12 21:13:47
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t13340033021

金虫 (正式写手)
记得木虫上有人讨论过 最近事情比较多 如果不急得话过2.3天PM我  我给你看看
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甲烷无敌
10楼2013-05-12 22:14:32
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