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hk289银虫 (小有名气)
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[求助]
请教下 多肽的CD测试结果如何分析
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近期做了多肽的圆二色谱分析想分析其构象在不同条件下的变化。测量时以Buffer作为空白并减去得到结果，有的时候会得到的信号图形全部在0以下，利用机子（Jasco J-810 circular dichroism spectropolarimeter）自带软件无法解析。可能信躁比太低（因为我对同一个样品连续测几次，结果不太一样），这到底怎么回事呢？请指点下。 有的样品利用机子自带的软件可以分析结果。这个程序分析结果的方法可能就是拿标准的螺旋、折叠、转角和无序曲线与样品曲线进行拟合计算，然后得出了各个二级结构所占的组分，因为看基本上大部分文献设计CD图，都会根据图形直接说这个是什么构象，我分析这个多肽的构象很奇怪，这个多肽（就10几个氨基酸组成）会形成这4种构象全部包括了，应该是怎样去分析这个得到的曲线？我得到的曲线跟标准的螺旋、折叠、转角和无序曲线差别较大，所以我也不能直接说这个构象就是螺旋或者什么的。麻烦指点下。 谢谢 |
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3楼2013-05-13 14:39:00
hk289
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谢谢你的关注 1波长190-260nm 2.HT低于600，190-200nm之间的信号高于400 3.没换样，比色皿位置也没动。测完得到曲线之后，再测一次。 4.自己自带的软件，名字我还真没记住，算法应该就是拿四个构象（螺旋、折叠、转角和无序）的标准曲线与测量得到的曲线进行拟合计算，算出哪部分满足哪种构象，会得到结果如：helix 20% turn 30% beta 40% random 10%，就是类似这样的结果。我现在就是搞不动文献中基本没提到过这种结果的，一般就是说曲线表示的是某个特定的构象？我是应该关注这些不同比例中占最大比例的构象还是由这些不同的构象比例会告诉我整体的构象到底是什么个东西？ |
4楼2013-05-13 16:38:38
