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alusia

金虫 (正式写手)

[交流] 羧酸氧原子无序严重怎么分裂?

分裂的方法好像有多种,请有经验的虫子多指导。一个羧基的氧和一个C分裂,其他参数都还好,但是checkCIF有如下几个关键错误,请问要加那些指令来处理呢?请大家知无不言,言无不尽啊。:)谢谢大家。

PLAT241_ALERT_2_A Check High      Ueq as Compared to Neighbors for         O1     
PLAT241_ALERT_2_A Check High      Ueq as Compared to Neighbors for         O2     
PLAT242_ALERT_2_A Check Low       Ueq as Compared to Neighbors for        C25

PLAT232_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff (M-X)  Cu1    -   O1      ..      14.24 su   
PLAT242_ALERT_2_B Check Low       Ueq as Compared to Neighbors for        Cu1

这几个错误我琢磨了一下,可以确定的是,B错误是A错误导致的,只要能把原子分裂做好,肯定能解决这几个错误,请做过分裂的虫子把自己的方法拿出来交流下,或许对我有莫大的帮助哦。先表示感谢了~~~:)。小小金币表示感谢。

补充说明,该结构可以描述如下。羧基基团为C25上连接两个O即O1, O2,O1与Cu1直接配位,O2则可以看过不参与配位。所以可以肯定的说,这些错误都是联系在一起的,因为这几个原子Cu1 O1 O2 C25都是连在一起的相邻原子。

[ Last edited by alusia on 2007-9-27 at 09:07 ]
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思念
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yt729

银虫 (小有名气)


alusia(金币+1,VIP+0):谢谢回复,我决定放弃了,保留A错误算了。:(
温度因子多少,残余峰多少,在这几个原子附近有没有较大的残余峰?
再有就是看一下.lst文件,看看这几个原子有没有可作统计分布的两个坐标
2楼2007-09-27 19:43:16
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xiaohai121

铁杆木虫 (小有名气)


alusia(金币+1,VIP+0):不知道您说的吸收校正怎么做?再测一次肯定不行的哦。:)
可以做一次吸收校正试试
3楼2007-09-27 23:55:18
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