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2012xiaoyao

银虫 (初入文坛)

[求助] 转录组----定量。所得的contig 和unigene 怎么选择做realtime

做了转录组,现在要做定量,选了一些基因, 可是每一个都有很多的contig 和 unigene,本人刚学,不知道怎么做,怎么选。。求
如

Unigene51078_All (5.9), CL822.Contig2_All (3.0), CL6889.Contig1_All (3.0), Unigene49977_All (2.7), Unigene49687_All (2.6), CL6561.Contig1_All (2.5), CL5063.Contig2_All (2.2), Unigene51455_All (2.0), CL764.Contig4_All (2.0), Unigene11343_All (1.7), Unigene836_All (1.6), CL7133.Contig1_All (1.5), CL1561.Contig3_All (1.4), Unigene20565_All (1.2), CL4555.Contig4_All (1.2), CL764.Contig2_All (1.2)
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2012xiaoyao

银虫 (初入文坛)

没人,怎么会没。自己顶。
终于升到这个级别了
2楼2013-05-03 09:55:45
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sdynyam

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
2012xiaoyao(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖交流! 2013-05-14 01:55:25
2012xiaoyao: 金币+15, ★★★很有帮助 2013-05-15 14:22:29
首先应该找到这些Unigene51078的基因序列,设计RT-PCR的引物,然后就是PCR的问题了,既然基因都确定了,这就好说了,找几篇转录组的文献,一看就懂了。别担心,其实转录组也没什么
3楼2013-05-13 20:22:12
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2012xiaoyao

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by sdynyam at 2013-05-13 20:22:12
首先应该找到这些Unigene51078的基因序列,设计RT-PCR的引物,然后就是PCR的问题了,既然基因都确定了,这就好说了,找几篇转录组的文献,一看就懂了。别担心,其实转录组也没什么

那这些选哪一个呢,依据什么标准呢
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4楼2013-05-15 14:26:15
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生物mishar

银虫 (小有名气)

请问,这个问题楼主后来怎么解决的?还有,怎么找Unigene51078的碱基序列呢?
5楼2015-04-27 17:17:55
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蘑菇1

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 2012xiaoyao at 2013-05-15 14:26:15
那这些选哪一个呢,依据什么标准呢...

Unigene设计Rt-PCR引物,有没有什么需要注意的啊
6楼2015-12-21 22:31:48
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