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疾风掠影

木虫 (正式写手)

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[交流] sspc和dgge有什么区别？主要是测试目标方面

请问下各位大神：sspc和dgge有什么区别？主要是测试目标方面

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1楼 2013-05-02 09:31:13

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gzl9901

铁杆木虫 (文坛精英)

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2楼2013-05-02 10:35:26

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liugs

禁虫 (正式写手)

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3楼2013-05-03 07:54:18

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happylj1985

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4楼2013-05-03 08:45:21

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flybrid1986

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stormxuhao: 金币+2, 积极应助 2013-05-03 09:14:53
疾风掠影: 金币+10 2013-05-03 09:34:08
疾风掠影: 金币+10 2013-06-06 22:51:28

DGGE 和SSCP 技术都是基于相同长度不同碱基序列的DNA 片段在电场中电泳迁移率不同而进行分离, 但两者形成电泳迁移率差异的原理不同。前者是双链DNA 分子在含梯度变性剂的聚丙烯酰胺凝胶中变性, 从而发生空间构型的变化;后者则是单链DNA 分子在非变性的聚丙烯酰胺凝胶中, 通过内部碱基配对形成不同的空间构象。DGGE 由于
GC 夹的特殊作用, 需要使用较长的PCR 引物, 加之PCR 产物中的异源双链DNA 分子, 在DGGE 图谱中可能会产生一些“假”条带; 而SSCP 则不受这两种因素的影响.
前者所需要的仪器比较简单也不贵,后者需要专门的电泳仪.效果上差不多,操作时,前者需要聚然降温,引物要磷酸化;后者引物要设计GC夹子.反正都比较麻烦,DGGE是一种健全地方法，一旦优选一个产物，他将很有效。结果也很容易检测出来，因为只要放在紫外灯下一看就能立刻看到突变。清晰的结果是DGGE的一个巨大的优点。另外一个优点是它不需要放射性标记。SSCP需要放射性PCR或者银染，并且结果不够清晰。另一方面，SSCP比DGGE需要的时间少，并且不需要昂贵的材料。这就是为什么大量的样本用这种方法的原因。例如，筛选少量的样本要求用SSCP。DGGE适合于少选大量的长周期的样本

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5楼2013-05-03 08:53:51

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疾风掠影

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引用回帖:

5楼: Originally posted by flybrid1986 at 2013-05-03 08:53:51
DGGE 和SSCP 技术都是基于相同长度不同碱基序列的DNA 片段在电场中电泳迁移率不同而进行分离, 但两者形成电泳迁移率差异的原理不同。前者是双链DNA 分子在含梯度变性剂的聚丙烯酰胺凝胶中变性, 从而发生空间构型的变 ...

你好
我的理解是分析多个微生物种群用sscp，然后筛选出小范围目标种群后用dgge，可以这样理解吗？
请赐教