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快乐小白兔

新虫 (小有名气)

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[求助] 氢键解析

该配合物应该有一个O—H•••N 分子内氢键，在单晶图上没有给出，请问哪位大神能够帮忙解一下这个氢键数据，主要是键长键角。

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附件 23 : Fig.1.tif

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附件 28 : mo_20111020a_0m.prp

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1楼 2013-04-27 16:17:14

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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

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【答案】应助回帖

Table 6 Hydrogen Bonds for .
D H A d(D-H)/Å d(H-A)/Å d(D-A)/Å D-H-A/°
C12 H12A Cl21 0.97 2.86 3.828(6) 177.5
C25 H25B Cl12 0.96 2.74 3.674(7) 165.8
C26 H26 Cl3 0.93 2.84 3.606(4) 140.6
C42 H42 Cl3 0.93 2.78 3.601(5) 147.5
C44 H44 Cl43 0.93 2.92 3.794(5) 157.9
C61 H61B Cl24 0.96 2.86 3.796(6) 164.6
C62 H62 Cl15 0.93 2.68 3.542(5) 154.3
11-X,-Y,1-Z; 2-X,1-Y,1-Z; 32-X,1-Y,-Z; 4+X,1+Y,+Z; 51+X,+Y,+Z

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3楼2013-04-27 16:30:21

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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

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【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

分子内没有O---H---N氢键，倒是有非经典H键：
HTAB C12 Cl2_$1
HTAB C25 Cl1_$2
HTAB C26 Cl3
HTAB C42 Cl3
HTAB C44 Cl4_$3
HTAB C61 Cl2_$4
HTAB C62 Cl1_$5

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2楼2013-04-27 16:28:01

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yytsnake

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
快乐小白兔: 金币+15, ★★★很有帮助, 非常感谢啊！ 2013-04-28 15:21:28

仔细看了一下，原来你的N上没有加H，重新加H后，H键为：
Table 6 Hydrogen Bonds for .
D H A d(D-H)/Å d(H-A)/Å d(D-A)/Å D-H-A/°
C12 H12A Cl21 0.97 2.86 3.829(6) 177.4
C25 H25B Cl12 0.96 2.74 3.673(7) 164.2
C26 H26 Cl3 0.93 2.84 3.605(4) 140.9
C42 H42 Cl3 0.93 2.78 3.600(5) 147.6
C44 H44 Cl43 0.93 2.92 3.794(5) 158.2
C61 H61B Cl24 0.96 2.86 3.797(6) 164.7
C62 H62 Cl15 0.93 2.67 3.538(5) 155.1
N1 H1 O2 0.86 1.89 2.587(5) 136.9
N2 H2 O4 0.86 1.88 2.576(5) 136.4
N3 H3 O6 0.86 1.90 2.602(5) 137.5
N4 H4 O7 0.86 1.89 2.586(5) 137.0
11-X,-Y,1-Z; 2-X,1-Y,1-Z; 32-X,1-Y,-Z; 4+X,1+Y,+Z; 51+X,+Y,+Z

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4楼2013-04-27 16:38:22

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454106649

木虫 (著名写手)

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引用回帖:

4楼: Originally posted by yytsnake at 2013-04-27 16:38:22
仔细看了一下，原来你的N上没有加H，重新加H后，H键为：
Table 6 Hydrogen Bonds for .
D H A d(D-H)/Å d(H-A)/Å d(D-A)/Å D-H-A/°
C12 H12A Cl21 0.97 2.86 3.829(6) 177.4
C25 H25B Cl12 0. ...

还在坚持用htab生成氢键表呀~赞一个！想起了当初刚学习的时候。可怕麻烦，已经不用了，太懒，呵呵

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454106649@qq.com

5楼2013-04-28 12:25:52

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