24小时热门版块排行榜    

查看: 3633  |  回复: 2

83910

金虫 (小有名气)

[求助] SSR跑胶结果如何确定基因位点以及等位基因数

本人是做SSR的新手,跑完胶之后要写论文了,不过不知道如何根据跑胶结果来确定有多少基因位点和等位基因数,下面是我用两个引物做出的跑胶结果,希望前辈们以这两张图为例子告诉怎么确认基因位点和等位基因数,非常感谢

IMG_1822.JPG



IMG_1844.JPG
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

berylstone

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
小丹木木: 金币+4, 鼓励积极热心应助 2013-05-29 16:06:02
一般来说,SSR在一个样本里只会跑出1-2条带,虽然也有超多带的情况,但是是少数。
因为SSR两侧的序列照道理是特异的,如果出现很多带,一般是引物设计的问题。

其次,会在一条主带下出现比主带稍浅的影子带,有时候不止一条。这也是正常的,很难避免。

楼主需要提供你用来跑微卫星的群体是怎样的?有没有可能在群体所有样本中都出现同样大小的一条带?
如果是野生群体,这应该不大可能。如果是一个家系,要看父母本的状况确定。

如果不大可能都出同一条带,那么下面都出现的带就是引物设计带来的在其他位点扩增出来的带,而非微卫星了。
2楼2013-05-29 13:20:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

berylstone

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
gyesang: 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-05-29 18:41:11
等位基因数要看这条引物在这个群体中所跑出来的所有的不相同的带的大小。如果影子带和原带相同较浓的话,稀释后再跑胶看看,如果没有出现影子带比原带淡,我们一般觉得影子带也是一条等位基因,而不是pcr过程造成的链滑动。
3楼2013-05-29 13:24:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 83910 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 TZqyNTBa07NP 2026-11-13 3/150 2026-11-15 11:47 by xSrQNSSjcgoX
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 TZqyNTBa07NP 2026-11-13 3/150 2026-11-15 10:30 by xSrQNSSjcgoX
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 TZqyNTBa07NP 2026-11-13 3/150 2026-11-15 10:19 by xSrQNSSjcgoX
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 SX5mJmPWDfOO 2026-11-13 3/150 2026-11-15 08:07 by xSrQNSSjcgoX
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 uKOSCocCb6Fm 2026-11-13 3/150 2026-11-15 05:11 by xSrQNSSjcgoX
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 uKOSCocCb6Fm 2026-11-13 3/150 2026-11-15 05:00 by xSrQNSSjcgoX
[基金申请] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 uKOSCocCb6Fm 2026-11-13 3/150 2026-11-15 04:16 by xSrQNSSjcgoX
[论文投稿] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 uKOSCocCb6Fm 2026-11-12 10/500 2026-11-15 02:15 by xSrQNSSjcgoX
[文学芳草园] 厉娜 +4 张丹枫1991 2026-11-09 6/300 2026-11-15 00:48 by Equinoxhua
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 YHiw1gou1Eda 2026-11-10 7/350 2026-11-14 22:44 by Equinoxhua
[考博] 27博士 +6 锦鲤送福至 2026-11-10 6/300 2026-11-14 21:23 by xupeii
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 1Nb0IVlmV6v0 2026-11-11 4/200 2026-11-13 11:18 by Equinoxhua
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 cdqGD6ftHmbl 2026-11-11 5/250 2026-11-12 12:28 by ECLTXnJnRSXf
[基金申请] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +5 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 7/350 2026-11-12 10:49 by HajghKOMynmz
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 5/250 2026-11-12 10:49 by HajghKOMynmz
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 6/300 2026-11-12 10:16 by HajghKOMynmz
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +7 FChKX8meu1ds 2026-11-09 9/450 2026-11-12 10:03 by HajghKOMynmz
[考研] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +8 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 12/600 2026-11-12 09:32 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +8 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 12/600 2026-11-12 09:21 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 FChKX8meu1ds 2026-11-09 7/350 2026-11-12 05:19 by 9fOTqj074tIg
信息提示
请填处理意见